Описание
A total of 192 populations of Quercus cerris from the eastern Mediterranean Basin (Italy, Balkan peninsula, Anatolia) were genotyped with six polymorphic chloroplast microsatellites, and the genetic diversity and differentiation of the populations were evaluated. DNA samples are kept in collection at -20° C and available for research use only.
Записи данных
Данные этого occurrence ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 1 175 записей.
Также в наличии 2 таблиц с данными расширений. Записи расширений содержат дополнительную информацию об основной записи. Число записей в каждой таблице данных расширения показано ниже.
Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. В таблице версий перечислены другие версии ресурса, которые были доступны публично, что позволяет отслеживать изменения, внесенные в ресурс с течением времени.
Версии
В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.
Как оформить ссылку
Исследователи должны дать ссылку на эту работу следующим образом:
Bagnoli F, Spanu I, Avanzi C, Vendramin GG, Piotti A (2024). Quercus cerris populations from Central-Eastern Europe and Middle East (IBBR-QUERCUS-CERRIS). Institute of Biosciences and Bioresources (IBBR), National Research Council of Italy (CNR). Occurrence dataset v.1.2. - doi: https://doi.org/10.15468/qwefvq
Права
Исследователи должны соблюдать следующие права:
Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR). Эта работа находится под лицензией Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC 4.0).
Регистрация в GBIF
Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: 3a80944e-06ce-4226-ac9f-052ff0dcbd97. Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR) отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке DiSSCo.
Ключевые слова
Occurrence; Specimen; Quercus cerris L.; Turkey oaks; Intraspecific biodiversity; Range-wide genetic variability; Forest tree populations
Внешние данные
Ресурс также доступен в других форматах
API JSON | https://biomemory.cnr.it/api/occurrences/json/?dataset=148 UTF-8 Darwin Core |
---|
Контакты
- Originator ●
- Point Of Contact
- Researcher
- v. Madonna del Piano 10
- Originator
- Researcher
- v. Madonna del Piano 10
- Originator
- Researcher
- v. Madonna del Piano 10
- Originator
- Research Director
- v. Madonna del Piano 10
- Originator
- Researcher
- v. Madonna del Piano 10
- Metadata Provider
- Senior Researcher
- v. Madonna del Piano 10
- Metadata Provider
- Senior Technologist
- v. F. De Blasio 5
- Content Provider
- Research Institute
- v. Madonna del Piano 10
- Publisher
Географический охват
Central Europe, Eastern Europe, Balkan peninsula, Middle East (Italy, Hungary, Slovakia, Serbia, Turkey, Bulgaria, Macedonia, Albania, Croatia, Romania, Bosnia, Slovenia, Greece, Austria, Lebanon, Ukraine, Montenegro)
Ограничивающие координаты | Юг Запад [33,783, 8,636], Север Восток [49,367, 37,4] |
---|
Таксономический охват
Quercus cerris L., Turkey oak
Kingdom | Plantae |
---|---|
Phylum | Tracheophyta |
Class | Magnoliopsida |
Order | Fagales |
Family | Fagaceae |
Временной охват
Период формирования | 2014-2016 |
---|
Данные проекта
ITINERIS - Activity 6.5 "Mining and mapping the functional biodiversity in vivo and ex-situ research collections" - This activity aims to provide biodiversity (meta)data linked to Natural Science Collections (NSC) in terms of extended digital specimens fully linked to related information (e.g.. images and videos, codification of functional traits, DNA and protein sequences, environmental parameters, etc.). The expected outcome of the activity is the implementation of a national network of biological research collections, including all the existing in vivo and ex-situ collections of biological organisms (animals, plants, fungi, algae, archaea, bacteria, viruses, etc.) that have been created and maintained through past and current research projects. || BioMemory (CNR-DiSBA Project No. SAC.AD002.173) is the network of biological collections of the Department of Biology, Agriculture and Food Sciences (DiSBA) of the National Research Council of Italy (CNR) for bio-monitoring, biodiversity conservation, agri-food and environmental sustainability, and human well-being. The project aims to create a network of biobanks (i.e., scientific research collections) where data and metadata associated with biological samples of different natures are collected and stored in a systematic and well-organized way. Maintaining the existing collections will allow their future use for many purposes, from the genetic improvement of organisms to face environmental changes (climate-ready organisms) to the fight against epidemics and pandemics affecting humans, animals, and plants.
Название | ITINERIS - Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System / BIOMEMORY |
---|---|
Идентификатор | PNRR Project IR0000032 | CNR SAC.AD002.173 |
Финансирование | PNRR project IR0000032 - ITINERIS, Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System - CUP B53C22002150006 (D.D. n. 130/2022) Funded by the EU - Next Generation EU - Mission 4 “Education and Research” - Component 2: “From research to business” - Investment 3.1: “Fund for the realisation of an integrated system of research and innovation infrastructures” || BioMemory (CNR-DiSBA Project No. SAC.AD002.173) |
Project Award |
ITINERIS - Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System https://doi.org/10.13039/501100021856 Ministero dell'Università e della Ricerca PNRR Project IR0000032 https://itineris.cnr.it BioMemory Project (CNR-DiSBA) https://doi.org/10.13039/501100004462 Consiglio Nazionale delle Ricerche CNR-DiSBA no. SAC.AD002.173 https://www.disba.cnr.it/en/ |
Исполнители проекта:
Методы сбора
Trees were randomly sampled from selected natural stands, with each population consisting of 42 to 50 individuals.
Охват исследования | Central and Eastern European populations of Quercus cerris L. have been considered, along with several populations from Turkey, |
---|
Описание этапа методики:
- None
Данные коллекции
Название коллекции | DNA and samples for genetic analyses on forest trees (CNR-IBBR-DNAFOR) |
---|---|
Идентификатор коллекции | 90a41989-9906-41d4-aff9-0dc8420c7a45 |
Методы сохранения образцов | Refrigerated |
---|
Библиографические ссылки
- Bagnoli, F., Tsuda, Y., Fineschi, S., Bruschi, P., Magri, D., Zhelev, P., Paule, L., Simeone, M.C., González-Martínez, S.C. and Vendramin, G.G. (2016), Combining molecular and fossil data to infer demographic history of Quercus cerris: insights on European eastern glacial refugia. J. Biogeogr., 43: 679-690. https://doi.org/10.1111/jbi.12673 https://doi.org/10.1111/jbi.12673
- Sebastiani, F., Carnevale, S. and Vendramin, G.G. (2004), A new set of mono- and dinucleotide chloroplast microsatellites in Fagaceae. Molecular Ecology Notes, 4: 259-261. https://doi.org/10.1111/j.1471-8286.2004.00635.x https://doi.org/10.1111/j.1471-8286.2004.00635.x
Дополнительные метаданные
Population genetics, Infraspecific biodiversity, Phylogeography, Adaptation, Climate change
Цель | The dataset includes more than 1,100 records of cryopreserved DNA and tissue samples of several forest tree species collected during past and current national and EU projects. The aim is to investigate the genetic makeup of their populations and assess their infraspecific biodiversity across Europe, from the biogeographical to the local level. |
---|---|
Описание частоты обновления ресурса | Tissues and DNA are stored at -20 °C. Updates will be included when new samples are collected. |
Альтернативные идентификаторы | 3a80944e-06ce-4226-ac9f-052ff0dcbd97 |
https://ipt.ibbr.cnr.it/ipt/resource?r=ibbr-quercus-cerris |