Quercus cerris populations from Central-Eastern Europe and Middle East (IBBR-QUERCUS-CERRIS)

オカレンス（観察データと標本)
最新バージョン Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR) により出版 2月 18, 2025 Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR)
ホーム:
https://biomemory.cnr.it/collections/CNR-IBBR-DNAFOR
公開日:
2025年2月18日
ライセンス:
CC-BY-NC 4.0

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説明

A total of 192 populations of Quercus cerris from the eastern Mediterranean Basin (Italy, Balkan peninsula, Anatolia) were genotyped with six polymorphic chloroplast microsatellites, and the genetic diversity and differentiation of the populations were evaluated. DNA samples are kept in collection at -20° C and available for research use only.

データ レコード

この オカレンス（観察データと標本) リソース内のデータは、1 つまたは複数のデータ テーブルとして生物多様性データを共有するための標準化された形式であるダーウィン コア アーカイブ (DwC-A) として公開されています。 コア データ テーブルには、1,175 レコードが含まれています。

拡張データ テーブルは2 件存在しています。拡張レコードは、コアのレコードについての追加情報を提供するものです。 各拡張データ テーブル内のレコード数を以下に示します。

Occurrence (コア)
1175
Amplification 
7050
Preservation 
1175

この IPT はデータをアーカイブし、データ リポジトリとして機能します。データとリソースのメタデータは、 ダウンロード セクションからダウンロードできます。 バージョン テーブルから公開可能な他のバージョンを閲覧でき、リソースに加えられた変更を知ることができます。

バージョン

次の表は、公にアクセス可能な公開バージョンのリソースのみ表示しています。

引用方法

研究者はこの研究内容を以下のように引用する必要があります。:

Bagnoli F, Spanu I, Avanzi C, Vendramin GG, Piotti A (2024). Quercus cerris populations from Central-Eastern Europe and Middle East (IBBR-QUERCUS-CERRIS). Institute of Biosciences and Bioresources (IBBR), National Research Council of Italy (CNR). Occurrence dataset v.1.2. - doi: https://doi.org/10.15468/qwefvq

権利

研究者は権利に関する下記ステートメントを尊重する必要があります。:

パブリッシャーとライセンス保持者権利者は Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR)。 This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC 4.0) License.

GBIF登録

このリソースをはGBIF と登録されており GBIF UUID: 3a80944e-06ce-4226-ac9f-052ff0dcbd97が割り当てられています。   DiSSCo によって承認されたデータ パブリッシャーとして GBIF に登録されているConsiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR) が、このリソースをパブリッシュしました。

キーワード

Occurrence; Specimen; Quercus cerris L.; Turkey oaks; Intraspecific biodiversity; Range-wide genetic variability; Forest tree populations

外部データ

リソース データは他の形式で入手可能です。

API JSON https://biomemory.cnr.it/api/occurrences/json/?dataset=148 UTF-8 Darwin Core

連絡先

Francesca Bagnoli
  • 最初のデータ採集者 ●
  • 連絡先
  • Researcher
CNR-IBBR-FI, Institute of Biosciences and Bioresources (IBBR) - Section of Sesto Fiorentino, National Research Council of Italy
  • v. Madonna del Piano 10
I-50019 Sesto Fiorentino
FI
IT
Ilaria Spanu
  • 最初のデータ採集者
  • Researcher
CNR-IBBR-FI, Institute of Biosciences and Bioresources (IBBR) - Section of Sesto Fiorentino, National Research Council of Italy
  • v. Madonna del Piano 10
I-50019 Sesto Fiorentino
FI
IT
Camilla Avanzi
  • 最初のデータ採集者
  • Researcher
CNR-IBBR-FI, Institute of Biosciences and Bioresources (IBBR) - Section of Sesto Fiorentino, National Research Council of Italy
  • v. Madonna del Piano 10
I-50019 Sesto Fiorentino
FI
IT
Giovanni Giuseppe Vendramin
  • 最初のデータ採集者
  • Research Director
CNR-IBBR-FI, Institute of Biosciences and Bioresources (IBBR) - Section of Sesto Fiorentino, National Research Council of Italy
  • v. Madonna del Piano 10
I-50019 Sesto Fiorentino
FI
IT
Andrea Piotti
  • 最初のデータ採集者
  • Researcher
CNR-IBBR-FI, Institute of Biosciences and Bioresources (IBBR) - Section of Sesto Fiorentino, National Research Council of Italy
  • v. Madonna del Piano 10
I-50019 Sesto Fiorentino
FI
IT
Gabriele Bucci
  • メタデータ提供者
  • Senior Researcher
CNR-IBBR, Institute of Biosciences and BioResources, National Research Council of Italy
  • v. Madonna del Piano 10
I-50019 Sesto Fiorentino
FI
IT
Massimo Ianigro
  • メタデータ提供者
  • Senior Technologist
CNR-IRSA-BA, Water Research Institute (IRSA) - Section of Bari, National Research Council of Italy
  • v. F. De Blasio 5
I-70132 Bari
BA
IT
Institute of Biosciences and BioResources CNR-IBBR
  • データ提供者
  • Research Institute
National Research Council of Italy (CNR)
  • v. Madonna del Piano 10
I-50019 Sesto Fiorentino
FI
IT
Department of Bio-Agri-Food Sciences CNR-DiSBA
  • データ公開者
National Research Council of Italy
IT-00100 Roma
RM
IT

地理的範囲

Central Europe, Eastern Europe, Balkan peninsula, Middle East (Italy, Hungary, Slovakia, Serbia, Turkey, Bulgaria, Macedonia, Albania, Croatia, Romania, Bosnia, Slovenia, Greece, Austria, Lebanon, Ukraine, Montenegro)

座標（緯度経度） 南 西 [33.783, 8.636], 北 東 [49.367, 37.4]

生物分類学的範囲

Quercus cerris L., Turkey oak

Kingdom Plantae
Phylum Tracheophyta
Class Magnoliopsida
Order Fagales
Family Fagaceae

時間的範囲

生成(収集）期間 2014-2016

プロジェクトデータ

ITINERIS - Activity 6.5 "Mining and mapping the functional biodiversity in vivo and ex-situ research collections" - This activity aims to provide biodiversity (meta)data linked to Natural Science Collections (NSC) in terms of extended digital specimens fully linked to related information (e.g.. images and videos, codification of functional traits, DNA and protein sequences, environmental parameters, etc.). The expected outcome of the activity is the implementation of a national network of biological research collections, including all the existing in vivo and ex-situ collections of biological organisms (animals, plants, fungi, algae, archaea, bacteria, viruses, etc.) that have been created and maintained through past and current research projects. || BioMemory (CNR-DiSBA Project No. SAC.AD002.173) is the network of biological collections of the Department of Biology, Agriculture and Food Sciences (DiSBA) of the National Research Council of Italy (CNR) for bio-monitoring, biodiversity conservation, agri-food and environmental sustainability, and human well-being. The project aims to create a network of biobanks (i.e., scientific research collections) where data and metadata associated with biological samples of different natures are collected and stored in a systematic and well-organized way. Maintaining the existing collections will allow their future use for many purposes, from the genetic improvement of organisms to face environmental changes (climate-ready organisms) to the fight against epidemics and pandemics affecting humans, animals, and plants.

タイトル ITINERIS - Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System / BIOMEMORY
識別子 PNRR Project IR0000032 | CNR SAC.AD002.173
ファンデイング PNRR project IR0000032 - ITINERIS, Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System - CUP B53C22002150006 (D.D. n. 130/2022) Funded by the EU - Next Generation EU - Mission 4 “Education and Research” - Component 2: “From research to business” - Investment 3.1: “Fund for the realisation of an integrated system of research and innovation infrastructures” || BioMemory (CNR-DiSBA Project No. SAC.AD002.173)
Project Award ITINERIS - Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System
https://doi.org/10.13039/501100021856
Ministero dell'Università e della Ricerca
PNRR Project IR0000032
https://itineris.cnr.it

BioMemory Project (CNR-DiSBA)
https://doi.org/10.13039/501100004462
Consiglio Nazionale delle Ricerche
CNR-DiSBA no. SAC.AD002.173
https://www.disba.cnr.it/en/

プロジェクトに携わる要員:

Eleonora Fornaro
  • プログラマー
Gabriele Bucci
  • Custodiansteward(保管者）
Marina Tumolo
  • メタデータ提供者
Massimo Ianigro
  • プログラマー
Giovanni Giuseppe Vendramin
  • 研究代表者

収集方法

Trees were randomly sampled from selected natural stands, with each population consisting of 42 to 50 individuals.

Study Extent Central and Eastern European populations of Quercus cerris L. have been considered, along with several populations from Turkey,

Method step description:

  1. None

コレクションデータ

コレクション名 DNA and samples for genetic analyses on forest trees (CNR-IBBR-DNAFOR)
コレクション識別子 90a41989-9906-41d4-aff9-0dc8420c7a45
標本保存方法 Refrigerated

書誌情報の引用

  1. Bagnoli, F., Tsuda, Y., Fineschi, S., Bruschi, P., Magri, D., Zhelev, P., Paule, L., Simeone, M.C., González-Martínez, S.C. and Vendramin, G.G. (2016), Combining molecular and fossil data to infer demographic history of Quercus cerris: insights on European eastern glacial refugia. J. Biogeogr., 43: 679-690. https://doi.org/10.1111/jbi.12673 https://doi.org/10.1111/jbi.12673
  2. Sebastiani, F., Carnevale, S. and Vendramin, G.G. (2004), A new set of mono- and dinucleotide chloroplast microsatellites in Fagaceae. Molecular Ecology Notes, 4: 259-261. https://doi.org/10.1111/j.1471-8286.2004.00635.x https://doi.org/10.1111/j.1471-8286.2004.00635.x

追加のメタデータ

Population genetics, Infraspecific biodiversity, Phylogeography, Adaptation, Climate change

目的

The dataset includes more than 1,100 records of cryopreserved DNA and tissue samples of several forest tree species collected during past and current national and EU projects. The aim is to investigate the genetic makeup of their populations and assess their infraspecific biodiversity across Europe, from the biogeographical to the local level.
メンテナンス内容 Tissues and DNA are stored at -20 °C. Updates will be included when new samples are collected.
代替識別子 3a80944e-06ce-4226-ac9f-052ff0dcbd97
https://ipt.ibbr.cnr.it/ipt/resource?r=ibbr-quercus-cerris