Описание
About 600 endophitic fungi isolated from Humulus lupulus and Crocus sativus and about 200 strains of lignicolous fungi from various forest environments of central Italy. Each strain was isolated in PDA medium, sub-cultured and stored in pdb-glicerol at -80 °C. Strain typing is ongoing by molecular analysis of ITS region. The collection will be screened for identification of potential biocontrol agents and enzymatic activities and metabolites of biotechnological interest.
Записи данных
Данные этого occurrence ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 501 записей.
Также в наличии 3 таблиц с данными расширений. Записи расширений содержат дополнительную информацию об основной записи. Число записей в каждой таблице данных расширения показано ниже.
Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. В таблице версий перечислены другие версии ресурса, которые были доступны публично, что позволяет отслеживать изменения, внесенные в ресурс с течением времени.
Версии
В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.
Как оформить ссылку
Исследователи должны дать ссылку на эту работу следующим образом:
Riccioni C, Belfiori B, Rubini A (2022). Dataset of endophytic and forest fungi (CNR-IBBR-FABI-01). Version 1.1. GBIF Secretariat. Occurrence dataset. - doi: https://doi.org/10.15468/arjsuy
Права
Исследователи должны соблюдать следующие права:
Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR). Эта работа находится под лицензией Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC 4.0).
Регистрация в GBIF
Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: 367d62ed-2a34-4512-bad1-d27b6eaf72b2. Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR) отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке DiSSCo.
Ключевые слова
Occurrence; Biotechnology; Secondary metabolites; Biocontrol; Cellulase; Lectins; Specimen
Внешние данные
Ресурс также доступен в других форматах
| API JSON | https://biomemory.cnr.it/api/occurrences/json/?dataset=120 UTF-8 Darwin Core |
|---|
Контакты
- Point Of Contact
- Researcher
- v. Madonna Alta 130
https://orcid.org/0000-0003-1069-8943
- Originator
- Researcher
- v. Madonna Alta 130
- Originator
- Senior Researcher
- v. Madonna Alta 130
- Metadata Provider
- Senior Researcher
- v. Madonna del Piano 10
- Metadata Provider
- Senior Technologist
- v. F. De Blasio 5
- Point Of Contact
- Reference Person
- v. Madonna Alta 130
- Content Provider
- Research Department
- p.le Aldo Moro 7
- Content Provider
- Research Institute
- v. Madonna Alta 130
Географический охват
Italy
| Ограничивающие координаты | Юг Запад [-90, -180], Север Восток [90, 180] |
|---|
Таксономический охват
Описание отсутсвует
| Kingdom | Fungi |
|---|---|
| Phylum | Zygomycota, Ascomycota, Basidiomycota |
| Class | Tremellomycetes, Microbotryomycetes, Dothideomycetes, Eurotiomycetes, Sordariomycetes, Saccharomycetes, Mucoromycetes, Agaricomycetes, Leotiomycetes |
| Order | Filobasidiales, Trichosphaeriales, Auriculariales, Sordariales, Mytilinidiales, Gloeophyllales, Cystofilobasidiales, Erysiphales, Helotiales, Mucorales, Chaetosphaeriales, Agaricales, Pleosporales, Glomerellales, Polyporales, Sporidiobolales, Eurotiales, Capnodiales, Hymenochaetales, Xylariales, Russulales, Hypocreales, Botryosphaeriales, Tremellales, Saccharomycetales, Cantharellales, Dothideales, Diaporthales, Amphisphaeriales |
| Family | Gloniaceae, Tricholomataceae, Chaetosphaeriaceae, Rhizopodaceae, Pleosporaceae, Fistulinaceae, Didymosphaeriaceae, Ganodermataceae, Strophariaceae, Ceratobasidiaceae, Ploettnerulaceae, Pleurotaceae, Peniophoraceae, Polyporaceae, Diaporthaceae, Omphalotaceae, Phaeosphaeriaceae, Bulleribasidiaceae, Gloeophyllaceae, Marasmiaceae, Apiosporaceae, Cladosporiaceae, Tremellaceae, Xylariaceae, Trichosphaeriaceae, Sporidiobolaceae, Clavicipitaceae, Auriculariaceae, Mucoraceae, Meruliaceae, Cordycipitaceae, Plectosphaerellaceae, Didymellaceae, Filobasidiaceae, Agaricaceae, Psathyrellaceae, Mycosphaerellaceae, Hypocreaceae, Periconiaceae, Sclerotiniaceae, Cystofilobasidiaceae, Aspergillaceae, Debaryomycetaceae, Valsaceae, Saccotheciaceae, Bartaliniaceae, Amorphothecaceae, Nectriaceae, Hymenochaetaceae, Fomitopsidaceae, Phanerochaetaceae, Chaetomiaceae, Hypoxylaceae, Glomerellaceae, Botryosphaeriaceae, Graphostromataceae |
Временной охват
| Период формирования | 2013-2020 |
|---|
Данные проекта
ITINERIS (PNRR Project IR0000032) Activity 6.5 "Mining and mapping the functional biodiversity in vivo and ex-situ research collections" - This activity is aimed to provide biodiversity (meta)data linked to Natural Science Collections (NSC) in terms of extended digital specimens fully linked to related information (e.g.. images and videos, codification of functional traits, DNA and protein sequences, environmental parameters, etc.). The expected outcome of the activity is the implementation of a national network of biological research collections, including all the existing in vivo and ex-situ collections of biological organisms (animals, plants, fungi, algae, archaea, bacteria, viruses, etc.) which have been created and maintained through past and current research projects. The full digitization of the research collections currently offline will be achieved along with the reorganization, standardization and harmonization of the data and metadata currently available in the main online collections. All the taxonomic, genetic, geographical, ecological, physiological information for each specimen will be organized in an easily searchable platform supported by web-GIS functionalities. Reference to genetic/genomic data for each specimen will allow for the identification of the most interesting material for further genetic/genomic analysis. The availability of such huge amount of information on plant, animal, and microbial genetic resources will pave the way for the dissection of the morpho-physiological and molecular mechanisms of adaptation to climate change. || BIOMEMORY (CNR-DiSBA Project No. SAC.AD002.173) is the network of biological collections of the Department of Biology, Agriculture and Food Sciences (DiSBA) of the National Research Council of Italy (CNR) for bio-monitoring, biodiversity conservation, agri-food and environmental sustainability, and human well-being. The project is aimed to create a network of biobanks (i.e., scientific research collections) where data and metadata associated to biological samples of different nature are collected and stored in a systematic and well-organized way. Maintaining the existing collections will allow their future use for a number of purposes, from the genetic improvement of organisms to face environmental changes (climate-ready organisms) to the fight against epidemics and pandemics affecting humans, animals and plants.
| Название | ITINERIS - Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System | BIOMEMORY |
|---|---|
| Идентификатор | PNRR Project IR0000032 | CNR SAC.AD002.173 |
| Финансирование | ITINERIS project no. IR0000032 — ITINERIS, Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System—CUP B53C22002150006 (D.D. n. 130/2022) Funded by the EU—Next Generation EU—Mission 4 “Education and Research”—Component 2: “From research to business”—Investment 3.1: “Fund for the realisation of an integrated system of research and innovation infrastructures” || BIOMEMORY (CNR-DiSBA Project No. SAC.AD002.173), |
| Project Award |
BioMemory Project (CNR-DiSBA) https://doi.org/10.13039/501100004462 Consiglio Nazionale delle Ricerche CNR-DiSBA no. SAC.AD002.173 https://www.disba.cnr.it/en/ ITINERIS - Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System https://doi.org/10.13039/501100021856 Ministero dell'Università e della Ricerca PNRR Project IR0000032 https://itineris.cnr.it/ |
Исполнители проекта:
Данные коллекции
| Название коллекции | Fungi of Agro-Biotechnological Interest (FABI) |
|---|---|
| Идентификатор коллекции | 2b6b8e4d-3b03-4d0b-845f-b8276e2ce9ae |
| Методы сохранения образцов | Deep frozen, Dried |
|---|
Библиографические ссылки
- Belfiori B, Rubini A, Riccioni C (2021). Diversity of Endophytic and Pathogenic Fungi of Saffron (Crocus sativus) Plants from Cultivation Sites in Italy. Diversity 13 (11): 535. https://doi.org/10.3390/d13110535
Дополнительные метаданные
n/a
| Acknowledgements | PNRR Project IR0000032—ITINERIS, Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System—CUP B53C22002150006 (D.D. n. 130/2022) Funded by the EU—Next Generation EU—Mission 4 “Education and Research”—Component 2: “From research to business”—Investment 3.1: “Fund for the realization of an integrated system of research and innovation infrastructures” CNR-DiSBA Project No. SAC.AD002.173 BioMemory - Network of scientific collections for bio-monitoring, biodiversity conservation, agri-food and environmental sustainability, and well-being. |
|---|---|
| Цель | Biotechnology |
| Описание частоты обновления ресурса | Long term storage in pdb-glicerol at -70 °C in test tubes. |
| Альтернативные идентификаторы | 367d62ed-2a34-4512-bad1-d27b6eaf72b2 |
| https://ipt.ibbr.cnr.it/ipt/resource?r=ibbr-cnr-fabi-01 |