Dataset of endophytic and forest fungi (IBBR-CNR-FABI-01)

Occurrence
Dernière version Publié par Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR) le févr. 18, 2025 Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR)

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Description

About 600 endophitic fungi isolated from Humulus lupulus and Crocus sativus and about 200 strains of lignicolous fungi from various forest environments of central Italy. Each strain was isolated in PDA medium, sub-cultured and stored in pdb-glicerol at -80 °C. Strain typing is ongoing by molecular analysis of ITS region. The collection will be screened for identification of potential biocontrol agents and enzymatic activities and metabolites of biotechnological interest.

Enregistrements de données

Les données de cette ressource occurrence ont été publiées sous forme d'une Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant qu'ensemble d'un ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 501 enregistrements.

3 tableurs de données d'extension existent également. Un enregistrement d'extension fournit des informations supplémentaires sur un enregistrement du cœur de standard (core). Le nombre d'enregistrements dans chaque tableur de données d'extension est illustré ci-dessous.

Occurrence (noyau)
501
Preservation 
501
GermplasmAccession 
501
dnaDerivedData 
38

Cet IPT archive les données et sert donc de dépôt de données. Les données et métadonnées de la ressource sont disponibles pour téléchargement dans la section téléchargements. Le tableau des versions liste les autres versions de chaque ressource rendues disponibles de façon publique et permet de tracer les modifications apportées à la ressource au fil du temps.

Versions

Le tableau ci-dessous n'affiche que les versions publiées de la ressource accessibles publiquement.

Comment citer

Les chercheurs doivent citer cette ressource comme suit:

Riccioni C, Belfiori B, Rubini A (2022). Dataset of endophytic and forest fungi (CNR-IBBR-FABI-01). Version 1.1. GBIF Secretariat. Occurrence dataset. - doi: https://doi.org/10.15468/arjsuy

Droits

Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:

L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR). Ce travail est sous licence Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0.

Enregistrement GBIF

Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède l'UUID GBIF suivante : 367d62ed-2a34-4512-bad1-d27b6eaf72b2.  Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR) publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec l'approbation du DiSSCo.

Mots-clé

Occurrence; Biotechnology; Secondary metabolites; Biocontrol; Cellulase; Lectins; Specimen

Données externes

Les données de la ressource sont disponibles dans d'autres formats

Contacts

Claudia Riccioni
  • Personne De Contact
  • Researcher
CNR-IBBR-PG, Institute of Biosciences and Bioresources (IBBR) - Section of Perugia, National Research Council of Italy
  • v. Madonna Alta 130
06128 Perugia
PG
IT
Beatrice Belfiori
  • Créateur
  • Researcher
CNR-IBBR-PG, Institute of Biosciences and Bioresources (IBBR) - Section of Perugia, National Research Council of Italy
  • v. Madonna Alta 130
06128 Perugia
PG
IT
Andrea Rubini
  • Créateur
  • Senior Researcher
CNR-IBBR-PG, Institute of Biosciences and Bioresources (IBBR) - Section of Perugia, National Research Council of Italy
  • v. Madonna Alta 130
06128 Perugia
PG
IT
Gabriele Bucci
  • Fournisseur Des Métadonnées
  • Senior Researcher
CNR-IBBR, Institute of Biosciences and BioResources, National Research Council of Italy
  • v. Madonna del Piano 10
I-50019 Sesto Fiorentino
FI
IT
Massimo Ianigro
  • Fournisseur Des Métadonnées
  • Senior Technologist
CNR-IRSA-BA, Water Research Institute (IRSA) - Section of Bari, National Research Council of Italy
  • v. F. De Blasio 5
I-70132 Bari
BA
IT
Claudia Riccioni
  • Personne De Contact
  • Reference Person
CNR-IBBR-PG, Institute of Biosciences and Bioresources (IBBR) - Section of Perugia
  • v. Madonna Alta 130
06128 Perugia
PG
IT
Dept. of Bio-Agrifood Sciences
  • Fournisseur De Contenu
  • Research Department
National Research Council of Italy (CNR)
  • p.le Aldo Moro 7
Rome
RM
IT
Institute of Biosciences and BioResources CNR-IBBR
  • Fournisseur De Contenu
  • Research Institute
National Research Council of Italy (CNR)
  • v. Madonna Alta 130
I-06128 Perugia
PG
IT

Couverture géographique

Italy

Enveloppe géographique Sud Ouest [-90, -180], Nord Est [90, 180]

Couverture taxonomique

Pas de description disponible

Kingdom Fungi
Phylum Zygomycota, Ascomycota, Basidiomycota
Class Tremellomycetes, Microbotryomycetes, Dothideomycetes, Eurotiomycetes, Sordariomycetes, Saccharomycetes, Mucoromycetes, Agaricomycetes, Leotiomycetes
Order Filobasidiales, Trichosphaeriales, Auriculariales, Sordariales, Mytilinidiales, Gloeophyllales, Cystofilobasidiales, Erysiphales, Helotiales, Mucorales, Chaetosphaeriales, Agaricales, Pleosporales, Glomerellales, Polyporales, Sporidiobolales, Eurotiales, Capnodiales, Hymenochaetales, Xylariales, Russulales, Hypocreales, Botryosphaeriales, Tremellales, Saccharomycetales, Cantharellales, Dothideales, Diaporthales, Amphisphaeriales
Family Gloniaceae, Tricholomataceae, Chaetosphaeriaceae, Rhizopodaceae, Pleosporaceae, Fistulinaceae, Didymosphaeriaceae, Ganodermataceae, Strophariaceae, Ceratobasidiaceae, Ploettnerulaceae, Pleurotaceae, Peniophoraceae, Polyporaceae, Diaporthaceae, Omphalotaceae, Phaeosphaeriaceae, Bulleribasidiaceae, Gloeophyllaceae, Marasmiaceae, Apiosporaceae, Cladosporiaceae, Tremellaceae, Xylariaceae, Trichosphaeriaceae, Sporidiobolaceae, Clavicipitaceae, Auriculariaceae, Mucoraceae, Meruliaceae, Cordycipitaceae, Plectosphaerellaceae, Didymellaceae, Filobasidiaceae, Agaricaceae, Psathyrellaceae, Mycosphaerellaceae, Hypocreaceae, Periconiaceae, Sclerotiniaceae, Cystofilobasidiaceae, Aspergillaceae, Debaryomycetaceae, Valsaceae, Saccotheciaceae, Bartaliniaceae, Amorphothecaceae, Nectriaceae, Hymenochaetaceae, Fomitopsidaceae, Phanerochaetaceae, Chaetomiaceae, Hypoxylaceae, Glomerellaceae, Botryosphaeriaceae, Graphostromataceae

Couverture temporelle

Epoque de formation 2013-2020

Données sur le projet

ITINERIS (PNRR Project IR0000032) Activity 6.5 "Mining and mapping the functional biodiversity in vivo and ex-situ research collections" - This activity is aimed to provide biodiversity (meta)data linked to Natural Science Collections (NSC) in terms of extended digital specimens fully linked to related information (e.g.. images and videos, codification of functional traits, DNA and protein sequences, environmental parameters, etc.). The expected outcome of the activity is the implementation of a national network of biological research collections, including all the existing in vivo and ex-situ collections of biological organisms (animals, plants, fungi, algae, archaea, bacteria, viruses, etc.) which have been created and maintained through past and current research projects. The full digitization of the research collections currently offline will be achieved along with the reorganization, standardization and harmonization of the data and metadata currently available in the main online collections. All the taxonomic, genetic, geographical, ecological, physiological information for each specimen will be organized in an easily searchable platform supported by web-GIS functionalities. Reference to genetic/genomic data for each specimen will allow for the identification of the most interesting material for further genetic/genomic analysis. The availability of such huge amount of information on plant, animal, and microbial genetic resources will pave the way for the dissection of the morpho-physiological and molecular mechanisms of adaptation to climate change. || BIOMEMORY (CNR-DiSBA Project No. SAC.AD002.173) is the network of biological collections of the Department of Biology, Agriculture and Food Sciences (DiSBA) of the National Research Council of Italy (CNR) for bio-monitoring, biodiversity conservation, agri-food and environmental sustainability, and human well-being. The project is aimed to create a network of biobanks (i.e., scientific research collections) where data and metadata associated to biological samples of different nature are collected and stored in a systematic and well-organized way. Maintaining the existing collections will allow their future use for a number of purposes, from the genetic improvement of organisms to face environmental changes (climate-ready organisms) to the fight against epidemics and pandemics affecting humans, animals and plants.

Titre ITINERIS - Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System | BIOMEMORY
Identifiant PNRR Project IR0000032 | CNR SAC.AD002.173
Financement ITINERIS project no. IR0000032 — ITINERIS, Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System—CUP B53C22002150006 (D.D. n. 130/2022) Funded by the EU—Next Generation EU—Mission 4 “Education and Research”—Component 2: “From research to business”—Investment 3.1: “Fund for the realisation of an integrated system of research and innovation infrastructures” || BIOMEMORY (CNR-DiSBA Project No. SAC.AD002.173),
Project Award BioMemory Project (CNR-DiSBA)
https://doi.org/10.13039/501100004462
Consiglio Nazionale delle Ricerche
CNR-DiSBA no. SAC.AD002.173
https://www.disba.cnr.it/en/

ITINERIS - Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System
https://doi.org/10.13039/501100021856
Ministero dell'Università e della Ricerca
PNRR Project IR0000032
https://itineris.cnr.it/

Les personnes impliquées dans le projet:

Giovanni Giuseppe Vendramin
Fulvio Pupilli
Eleonora Fornaro
Marina Tumolo
Massimo Ianigro
Gabriele Bucci

Données de collection

Nom de la collection Fungi of Agro-Biotechnological Interest (FABI)
Identifiant de collection 2b6b8e4d-3b03-4d0b-845f-b8276e2ce9ae
Méthode de conservation des spécimens Deep frozen,  Dried

Citations bibliographiques

  1. Belfiori B, Rubini A, Riccioni C (2021). Diversity of Endophytic and Pathogenic Fungi of Saffron (Crocus sativus) Plants from Cultivation Sites in Italy. Diversity 13 (11): 535. https://doi.org/10.3390/d13110535

Métadonnées additionnelles

n/a

Acknowledgements

PNRR Project IR0000032—ITINERIS, Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System—CUP B53C22002150006 (D.D. n. 130/2022) Funded by the EU—Next Generation EU—Mission 4 “Education and Research”—Component 2: “From research to business”—Investment 3.1: “Fund for the realization of an integrated system of research and innovation infrastructures”

CNR-DiSBA Project No. SAC.AD002.173 BioMemory - Network of scientific collections for bio-monitoring, biodiversity conservation, agri-food and environmental sustainability, and well-being.

Objet

Biotechnology

Description de la fréquence de mise à jour Long term storage in pdb-glicerol at -70 °C in test tubes.
Identifiants alternatifs 367d62ed-2a34-4512-bad1-d27b6eaf72b2
https://ipt.ibbr.cnr.it/ipt/resource?r=ibbr-cnr-fabi-01