Dataset of endophytic and forest fungi (IBBR-CNR-FABI-01)

Registros biológicos
Última versión publicado por Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR) el feb. 18, 2025 Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR)

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Descripción

About 600 endophitic fungi isolated from Humulus lupulus and Crocus sativus and about 200 strains of lignicolous fungi from various forest environments of central Italy. Each strain was isolated in PDA medium, sub-cultured and stored in pdb-glicerol at -80 °C. Strain typing is ongoing by molecular analysis of ITS region. The collection will be screened for identification of potential biocontrol agents and enzymatic activities and metabolites of biotechnological interest.

Registros

Los datos en este recurso de registros biológicos han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 501 registros.

también existen 3 tablas de datos de extensiones. Un registro en una extensión provee información adicional sobre un registro en el core. El número de registros en cada tabla de datos de la extensión se ilustra a continuación.

Occurrence (core)
501
Preservation 
501
GermplasmAccession 
501
dnaDerivedData 
38

Este IPT archiva los datos y, por lo tanto, sirve como repositorio de datos. Los datos y los metadatos del recurso están disponibles para su descarga en la sección descargas. La tabla versiones enumera otras versiones del recurso que se han puesto a disposición del público y permite seguir los cambios realizados en el recurso a lo largo del tiempo.

Versiones

La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.

¿Cómo referenciar?

Los usuarios deben citar este trabajo de la siguiente manera:

Riccioni C, Belfiori B, Rubini A (2022). Dataset of endophytic and forest fungi (CNR-IBBR-FABI-01). Version 1.1. GBIF Secretariat. Occurrence dataset. - doi: https://doi.org/10.15468/arjsuy

Derechos

Los usuarios deben respetar los siguientes derechos de uso:

El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR). Esta obra está bajo una licencia Creative Commons de Atribución/Reconocimiento-NoComercial (CC-BY-NC 4.0).

Registro GBIF

Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: 367d62ed-2a34-4512-bad1-d27b6eaf72b2.  Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR) publica este recurso y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por DiSSCo.

Palabras clave

Occurrence; Biotechnology; Secondary metabolites; Biocontrol; Cellulase; Lectins; Specimen

Datos externos

Los datos del recurso también están disponibles en otros formatos

Contactos

Claudia Riccioni
  • Punto De Contacto
  • Researcher
CNR-IBBR-PG, Institute of Biosciences and Bioresources (IBBR) - Section of Perugia, National Research Council of Italy
  • v. Madonna Alta 130
06128 Perugia
PG
IT
Beatrice Belfiori
  • Originador
  • Researcher
CNR-IBBR-PG, Institute of Biosciences and Bioresources (IBBR) - Section of Perugia, National Research Council of Italy
  • v. Madonna Alta 130
06128 Perugia
PG
IT
Andrea Rubini
  • Originador
  • Senior Researcher
CNR-IBBR-PG, Institute of Biosciences and Bioresources (IBBR) - Section of Perugia, National Research Council of Italy
  • v. Madonna Alta 130
06128 Perugia
PG
IT
Gabriele Bucci
  • Proveedor De Los Metadatos
  • Senior Researcher
CNR-IBBR, Institute of Biosciences and BioResources, National Research Council of Italy
  • v. Madonna del Piano 10
I-50019 Sesto Fiorentino
FI
IT
Massimo Ianigro
  • Proveedor De Los Metadatos
  • Senior Technologist
CNR-IRSA-BA, Water Research Institute (IRSA) - Section of Bari, National Research Council of Italy
  • v. F. De Blasio 5
I-70132 Bari
BA
IT
Claudia Riccioni
  • Punto De Contacto
  • Reference Person
CNR-IBBR-PG, Institute of Biosciences and Bioresources (IBBR) - Section of Perugia
  • v. Madonna Alta 130
06128 Perugia
PG
IT
Dept. of Bio-Agrifood Sciences
  • Proveedor De Contenido
  • Research Department
National Research Council of Italy (CNR)
  • p.le Aldo Moro 7
Rome
RM
IT
Institute of Biosciences and BioResources CNR-IBBR
  • Proveedor De Contenido
  • Research Institute
National Research Council of Italy (CNR)
  • v. Madonna Alta 130
I-06128 Perugia
PG
IT

Cobertura geográfica

Italy

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [-90, -180], Latitud Máxima Longitud Máxima [90, 180]

Cobertura taxonómica

No hay descripción disponible

Reino Fungi
Filo Zygomycota, Ascomycota, Basidiomycota
Class Tremellomycetes, Microbotryomycetes, Dothideomycetes, Eurotiomycetes, Sordariomycetes, Saccharomycetes, Mucoromycetes, Agaricomycetes, Leotiomycetes
Orden Filobasidiales, Trichosphaeriales, Auriculariales, Sordariales, Mytilinidiales, Gloeophyllales, Cystofilobasidiales, Erysiphales, Helotiales, Mucorales, Chaetosphaeriales, Agaricales, Pleosporales, Glomerellales, Polyporales, Sporidiobolales, Eurotiales, Capnodiales, Hymenochaetales, Xylariales, Russulales, Hypocreales, Botryosphaeriales, Tremellales, Saccharomycetales, Cantharellales, Dothideales, Diaporthales, Amphisphaeriales
Familia Gloniaceae, Tricholomataceae, Chaetosphaeriaceae, Rhizopodaceae, Pleosporaceae, Fistulinaceae, Didymosphaeriaceae, Ganodermataceae, Strophariaceae, Ceratobasidiaceae, Ploettnerulaceae, Pleurotaceae, Peniophoraceae, Polyporaceae, Diaporthaceae, Omphalotaceae, Phaeosphaeriaceae, Bulleribasidiaceae, Gloeophyllaceae, Marasmiaceae, Apiosporaceae, Cladosporiaceae, Tremellaceae, Xylariaceae, Trichosphaeriaceae, Sporidiobolaceae, Clavicipitaceae, Auriculariaceae, Mucoraceae, Meruliaceae, Cordycipitaceae, Plectosphaerellaceae, Didymellaceae, Filobasidiaceae, Agaricaceae, Psathyrellaceae, Mycosphaerellaceae, Hypocreaceae, Periconiaceae, Sclerotiniaceae, Cystofilobasidiaceae, Aspergillaceae, Debaryomycetaceae, Valsaceae, Saccotheciaceae, Bartaliniaceae, Amorphothecaceae, Nectriaceae, Hymenochaetaceae, Fomitopsidaceae, Phanerochaetaceae, Chaetomiaceae, Hypoxylaceae, Glomerellaceae, Botryosphaeriaceae, Graphostromataceae

Cobertura temporal

Periodo de formación 2013-2020

Datos del proyecto

ITINERIS (PNRR Project IR0000032) Activity 6.5 "Mining and mapping the functional biodiversity in vivo and ex-situ research collections" - This activity is aimed to provide biodiversity (meta)data linked to Natural Science Collections (NSC) in terms of extended digital specimens fully linked to related information (e.g.. images and videos, codification of functional traits, DNA and protein sequences, environmental parameters, etc.). The expected outcome of the activity is the implementation of a national network of biological research collections, including all the existing in vivo and ex-situ collections of biological organisms (animals, plants, fungi, algae, archaea, bacteria, viruses, etc.) which have been created and maintained through past and current research projects. The full digitization of the research collections currently offline will be achieved along with the reorganization, standardization and harmonization of the data and metadata currently available in the main online collections. All the taxonomic, genetic, geographical, ecological, physiological information for each specimen will be organized in an easily searchable platform supported by web-GIS functionalities. Reference to genetic/genomic data for each specimen will allow for the identification of the most interesting material for further genetic/genomic analysis. The availability of such huge amount of information on plant, animal, and microbial genetic resources will pave the way for the dissection of the morpho-physiological and molecular mechanisms of adaptation to climate change. || BIOMEMORY (CNR-DiSBA Project No. SAC.AD002.173) is the network of biological collections of the Department of Biology, Agriculture and Food Sciences (DiSBA) of the National Research Council of Italy (CNR) for bio-monitoring, biodiversity conservation, agri-food and environmental sustainability, and human well-being. The project is aimed to create a network of biobanks (i.e., scientific research collections) where data and metadata associated to biological samples of different nature are collected and stored in a systematic and well-organized way. Maintaining the existing collections will allow their future use for a number of purposes, from the genetic improvement of organisms to face environmental changes (climate-ready organisms) to the fight against epidemics and pandemics affecting humans, animals and plants.

Título ITINERIS - Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System | BIOMEMORY
Identificador PNRR Project IR0000032 | CNR SAC.AD002.173
Fuentes de Financiación ITINERIS project no. IR0000032 — ITINERIS, Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System—CUP B53C22002150006 (D.D. n. 130/2022) Funded by the EU—Next Generation EU—Mission 4 “Education and Research”—Component 2: “From research to business”—Investment 3.1: “Fund for the realisation of an integrated system of research and innovation infrastructures” || BIOMEMORY (CNR-DiSBA Project No. SAC.AD002.173),
Project Award BioMemory Project (CNR-DiSBA)
https://doi.org/10.13039/501100004462
Consiglio Nazionale delle Ricerche
CNR-DiSBA no. SAC.AD002.173
https://www.disba.cnr.it/en/

ITINERIS - Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System
https://doi.org/10.13039/501100021856
Ministero dell'Università e della Ricerca
PNRR Project IR0000032
https://itineris.cnr.it/

Personas asociadas al proyecto:

Giovanni Giuseppe Vendramin
Fulvio Pupilli
Eleonora Fornaro
Marina Tumolo
Massimo Ianigro
Gabriele Bucci

Datos de la colección

Nombre de la Colección Fungi of Agro-Biotechnological Interest (FABI)
Identificador de la Colección 2b6b8e4d-3b03-4d0b-845f-b8276e2ce9ae
Métodos de preservación de los ejemplares Congelado,  Secado

Referencias bibliográficas

  1. Belfiori B, Rubini A, Riccioni C (2021). Diversity of Endophytic and Pathogenic Fungi of Saffron (Crocus sativus) Plants from Cultivation Sites in Italy. Diversity 13 (11): 535. https://doi.org/10.3390/d13110535

Metadatos adicionales

n/a

Agradecimientos

PNRR Project IR0000032—ITINERIS, Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System—CUP B53C22002150006 (D.D. n. 130/2022) Funded by the EU—Next Generation EU—Mission 4 “Education and Research”—Component 2: “From research to business”—Investment 3.1: “Fund for the realization of an integrated system of research and innovation infrastructures”

CNR-DiSBA Project No. SAC.AD002.173 BioMemory - Network of scientific collections for bio-monitoring, biodiversity conservation, agri-food and environmental sustainability, and well-being.

Propósito

Biotechnology

Descripción de mantenimiento Long term storage in pdb-glicerol at -70 °C in test tubes.
Identificadores alternativos 367d62ed-2a34-4512-bad1-d27b6eaf72b2
https://ipt.ibbr.cnr.it/ipt/resource?r=ibbr-cnr-fabi-01