説明
Some 1168 silver fir trees from 24 natural populations sampled across italy and the Balkanian peninsula have been fully genotyped using a set of 16 SSR loci. Needles have been collected from georeferenced, individual trees in the forest, transported to the lab and kept at -80 °C for long-term storage. DNA has been extracted from each tissue sample for purpose of population genetic studies and evolutionary history reconstruction, and it is currently maintained at -20 *C for future research.
データ レコード
この オカレンス(観察データと標本) リソース内のデータは、1 つまたは複数のデータ テーブルとして生物多様性データを共有するための標準化された形式であるダーウィン コア アーカイブ (DwC-A) として公開されています。 コア データ テーブルには、1,167 レコードが含まれています。
拡張データ テーブルは1 件存在しています。拡張レコードは、コアのレコードについての追加情報を提供するものです。 各拡張データ テーブル内のレコード数を以下に示します。
この IPT はデータをアーカイブし、データ リポジトリとして機能します。データとリソースのメタデータは、 ダウンロード セクションからダウンロードできます。 バージョン テーブルから公開可能な他のバージョンを閲覧でき、リソースに加えられた変更を知ることができます。
バージョン
次の表は、公にアクセス可能な公開バージョンのリソースのみ表示しています。
引用方法
研究者はこの研究内容を以下のように引用する必要があります。:
Piotti A, Bagnoli F, Avanzi C, Spanu I, Vendramin G G, Postolache D, Brousseau L, Leonarduzzi C, Leonardi S, Bucci G, Ianigro M (2025). Abies alba natural populations of Italy and Balkans (IBBR-ABIES-ALBA). Version 1.2. Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR). Occurrence dataset. https://doi.org/10.15468/3ccqf4
権利
研究者は権利に関する下記ステートメントを尊重する必要があります。:
パブリッシャーとライセンス保持者権利者は Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR)。 This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0) License.
GBIF登録
このリソースをはGBIF と登録されており GBIF UUID: b039a7fc-9e9a-438e-9187-5ada8a69c5b3が割り当てられています。 DiSSCo によって承認されたデータ パブリッシャーとして GBIF に登録されているConsiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR) が、このリソースをパブリッシュしました。
キーワード
Occurrence; Silver fir; Conservation; Forest trees; Abies alba; Genetic diversity; Gene flow; Specimen
外部データ
リソース データは他の形式で入手可能です。
JSON DwC Format | https://biomemory.cnr.it/api/occurrences/json/?dataset=112 UTF8 JSON |
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連絡先
- 連絡先
- Researcher
- v. Madonna del Piano 10
- 最初のデータ採集者
- Researcher
- v. Madonna del Piano 10
- 最初のデータ採集者
- Researcher
- v. Madonna del Piano 10
- 最初のデータ採集者
- Researcher
- v. Madonna del Piano 10
- 最初のデータ採集者
- Research Director
- v. Madonna del Piano 10
- 最初のデータ採集者
- 最初のデータ採集者
- Domaine Saint Paul
- 最初のデータ採集者
- メタデータ提供者
- Senior Researcher
- v. Madonna del Piano 10
- メタデータ提供者
- Senior Technologist
- v. F. De Blasio 5
- 連絡先
- Reference Person
- v. Madonna del Piano 10
- データ提供者
- Research Institute
- v. Madonna del Piano 10
- データ所有者
地理的範囲
Italy, Romania, Bulgaria, Serbia
座標(緯度経度) | 南 西 [38.144, 6.889], 北 東 [46.49, 24.696] |
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生物分類学的範囲
Natural populations of Abies alba Mill.
Kingdom | Plantae |
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Phylum | Tracheophyta |
Class | Pinopsida |
Order | Pinales |
Family | Pinaceae |
時間的範囲
生成(収集)期間 | 2016-2017 |
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プロジェクトデータ
ITINERIS - Activity 6.5 "Mining and mapping the functional biodiversity in vivo and ex-situ research collections" - This activity aims to provide biodiversity (meta)data linked to Natural Science Collections (NSC) in terms of extended digital specimens fully linked to related information (e.g.. images and videos, codification of functional traits, DNA and protein sequences, environmental parameters, etc.). The expected outcome of the activity is the implementation of a national network of biological research collections, including all the existing in vivo and ex-situ collections of biological organisms (animals, plants, fungi, algae, archaea, bacteria, viruses, etc.) that have been created and maintained through past and current research projects. BioMemory (CNR-DiSBA Project No. SAC.AD002.173) is the network of biological collections of the Department of Biology, Agriculture and Food Sciences (DiSBA) of the National Research Council of Italy (CNR) for bio-monitoring, biodiversity conservation, agri-food and environmental sustainability, and human well-being. The project aims to create a network of biobanks (i.e., scientific research collections) where data and metadata associated with biological samples of different natures are collected and stored in a systematic and well-organized way. Maintaining the existing collections will allow their future use for many purposes, from the genetic improvement of organisms to face environmental changes (climate-ready organisms) to the fight against epidemics and pandemics affecting humans, animals, and plants.
タイトル | ITINERIS - Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System | BIOMEMORY Project |
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識別子 | PNRR Project IR0000032 | CNR-DiSBA no. SAC.AD002.173 |
ファンデイング | PNRR project IR0000032 - ITINERIS, Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System - CUP B53C22002150006 (D.D. n. 130/2022) Funded by the EU - Next Generation EU - Mission 4 “Education and Research” - Component 2: “From research to business” - Investment 3.1: “Fund for the realisation of an integrated system of research and innovation infrastructures” || BioMemory (CNR-DiSBA Project No. SAC.AD002.173) |
Project Award |
BioMemory Project (CNR-DiSBA) https://doi.org/10.13039/501100004462 Consiglio Nazionale delle Ricerche CNR-DiSBA no. SAC.AD002.173 https://www.disba.cnr.it/en/ ITINERIS - Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System https://doi.org/10.13039/501100021856 Ministero dell'Università e della Ricerca PNRR Project IR0000032 https://itineris.cnr.it/ |
プロジェクトに携わる要員:
コレクションデータ
コレクション名 | DNA and samples for genetic analyses on forest trees (CNR-IBBR-DNAFOR) |
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コレクション識別子 | 90a41989-9906-41d4-aff9-0dc8420c7a45 |
標本保存方法 | Deep frozen, Dried |
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書誌情報の引用
- Piotti, A., Leonarduzzi, C., Postolache, D., Bagnoli, F., Spanu, I., Brousseau, L., Urbinati, C., Leonardi, S. and Vendramin, G.G. (2017), Unexpected scenarios from Mediterranean refugial areas: disentangling complex demographic dynamics along the Apennine distribution of silver fir. Journal of Biogeography, 44: 1547-1558. https://doi.org/10.1111/jbi.13011
- Santini F., Andrisano T., Leonardi S., Ciaschetti G., Labriola M.C., Vendramin G.G., Piotti A. (2018). Tracking the origin of silver fir plantations along the boundary between different genetic clusters in central Apennines: Implications for their management. Forest Ecology and Management 408: 220-227. https://doi.org/10.1016/j.foreco.2017.10.045
追加のメタデータ
A sample of preserved material is available upon request for authors.
謝辞 | PNRR Project IR0000032—ITINERIS, Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System—CUP B53C22002150006 (D.D. n. 130/2022) Funded by the EU—Next Generation EU—Mission 4 “Education and Research”—Component 2: “From research to business”—Investment 3.1: “Fund for the realization of an integrated system of research and innovation infrastructures” CNR-DiSBA Project No. SAC.AD002.173 BioMemory - Network of scientific collections for bio-monitoring, biodiversity conservation, agri-food and environmental sustainability, and well-being. |
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目的 | Population genetics, Infraspecific biodiversity, Phylogeography, Adaptation, Climate change |
メンテナンス内容 | Dried tissues and DNA at -20 °C |
代替識別子 | b039a7fc-9e9a-438e-9187-5ada8a69c5b3 |
https://ipt.ibbr.cnr.it/ipt/resource?r=ibbr-abies-alba |