Abies alba natural populations of Italy and Balkans (IBBR-ABIES-ALBA)

Registros biológicos
Última versión publicado por Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR) el feb. 18, 2025 Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR)
Inicio:
https://biomemory.cnr.it/collections/cnr-ibbr-dnafor
Fecha de publicación:
18 de febrero de 2025
Licencia:
CC-BY 4.0

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Descripción

Some 1168 silver fir trees from 24 natural populations sampled across italy and the Balkanian peninsula have been fully genotyped using a set of 16 SSR loci. Needles have been collected from georeferenced, individual trees in the forest, transported to the lab and kept at -80 °C for long-term storage. DNA has been extracted from each tissue sample for purpose of population genetic studies and evolutionary history reconstruction, and it is currently maintained at -20 *C for future research.

Registros

Los datos en este recurso de registros biológicos han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 1.167 registros.

también existen 1 tablas de datos de extensiones. Un registro en una extensión provee información adicional sobre un registro en el core. El número de registros en cada tabla de datos de la extensión se ilustra a continuación.

Occurrence (core)
1167
Amplification 
18672

Este IPT archiva los datos y, por lo tanto, sirve como repositorio de datos. Los datos y los metadatos del recurso están disponibles para su descarga en la sección descargas. La tabla versiones enumera otras versiones del recurso que se han puesto a disposición del público y permite seguir los cambios realizados en el recurso a lo largo del tiempo.

Versiones

La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.

¿Cómo referenciar?

Los usuarios deben citar este trabajo de la siguiente manera:

Piotti A, Bagnoli F, Avanzi C, Spanu I, Vendramin G G, Postolache D, Brousseau L, Leonarduzzi C, Leonardi S, Bucci G, Ianigro M (2025). Abies alba natural populations of Italy and Balkans (IBBR-ABIES-ALBA). Version 1.2. Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR). Occurrence dataset. https://doi.org/10.15468/3ccqf4

Derechos

Los usuarios deben respetar los siguientes derechos de uso:

El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR). Esta obra está bajo una licencia Creative Commons de Atribución/Reconocimiento (CC-BY 4.0).

Registro GBIF

Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: b039a7fc-9e9a-438e-9187-5ada8a69c5b3.  Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR) publica este recurso y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por DiSSCo.

Palabras clave

Occurrence; Silver fir; Conservation; Forest trees; Abies alba; Genetic diversity; Gene flow; Specimen

Datos externos

Los datos del recurso también están disponibles en otros formatos

JSON DwC Format https://biomemory.cnr.it/api/occurrences/json/?dataset=112 UTF8 JSON

Contactos

Andrea Piotti
  • Punto De Contacto
  • Researcher
CNR-IBBR-FI, Institute of Biosciences and Bioresources (IBBR) - Section of Sesto Fiorentino, National Research Council of Italy
  • v. Madonna del Piano 10
I-50019 Sesto Fiorentino
FI
IT
Francesca Bagnoli
  • Originador
  • Researcher
CNR-IBBR-FI, Institute of Biosciences and Bioresources (IBBR) - Section of Sesto Fiorentino, National Research Council of Italy
  • v. Madonna del Piano 10
I-50019 Sesto Fiorentino
FI
IT
Camilla Avanzi
  • Originador
  • Researcher
CNR-IBBR-FI, Institute of Biosciences and Bioresources (IBBR) - Section of Sesto Fiorentino, National Research Council of Italy
  • v. Madonna del Piano 10
I-50019 Sesto Fiorentino
FI
IT
Ilaria Spanu
  • Originador
  • Researcher
CNR-IBBR-FI, Institute of Biosciences and Bioresources (IBBR) - Section of Sesto Fiorentino, National Research Council of Italy
  • v. Madonna del Piano 10
I-50019 Sesto Fiorentino
FI
IT
Giovanni Giuseppe Vendramin
  • Originador
  • Research Director
CNR-IBBR-FI, Institute of Biosciences and Bioresources (IBBR) - Section of Sesto Fiorentino, National Research Council of Italy
  • v. Madonna del Piano 10
I-50019 Sesto Fiorentino
FI
IT
Dragos Postolache
  • Originador
National Research and Development Institute in Forestry "Marin Dracea"
400275 Cluj-Napoca
RO
Louise Brousseau
  • Originador
INRA, UR629 URFM Ecologie des Forêts Méditerranéennes
  • Domaine Saint Paul
84914 Avignon Cedex 9
FR
Cristina Leonarduzzi
  • Originador
CNR-IBBR Institute of Biosciences and Bioresources, National Research Council of Italy
IT-50019 Sesto Fiorentino
FI
IT
Stefano Leonardi
  • Originador
University of Parma
43124 Parma
IT
Gabriele Bucci
  • Proveedor De Los Metadatos
  • Senior Researcher
CNR-IBBR, Institute of Biosciences and BioResources, National Research Council of Italy
  • v. Madonna del Piano 10
I-50019 Sesto Fiorentino
FI
Massimo Ianigro
  • Proveedor De Los Metadatos
  • Senior Technologist
CNR-IRSA-BA, Water Research Institute (IRSA) - Section of Bari, National Research Council of Italy
  • v. F. De Blasio 5
I-70132 Bari
BA
IT
Andrea Piotti
  • Punto De Contacto
  • Reference Person
CNR-IBBR-FI, Institute of Biosciences and Bioresources (IBBR) - Section of Sesto Fiorentino
  • v. Madonna del Piano 10
I-50019 Sesto Fiorentino
FI
IT
Institute of Biosciences and BioResources CNR-IBBR
  • Proveedor De Contenido
  • Research Institute
National Research Council of Italy (CNR)
  • v. Madonna del Piano 10
I-50019 Sesto Fiorentino
FI
IT
Dept. of Bio-Agrifood Sciences
  • Propietario
National Research Council of Italy (CNR)
IT-00100 Rome
RM
IT

Cobertura geográfica

Italy, Romania, Bulgaria, Serbia

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [38,144, 6,889], Latitud Máxima Longitud Máxima [46,49, 24,696]

Cobertura taxonómica

Natural populations of Abies alba Mill.

Reino Plantae
Filo Tracheophyta
Class Pinopsida
Orden Pinales
Familia Pinaceae

Cobertura temporal

Periodo de formación 2016-2017

Datos del proyecto

ITINERIS - Activity 6.5 "Mining and mapping the functional biodiversity in vivo and ex-situ research collections" - This activity aims to provide biodiversity (meta)data linked to Natural Science Collections (NSC) in terms of extended digital specimens fully linked to related information (e.g.. images and videos, codification of functional traits, DNA and protein sequences, environmental parameters, etc.). The expected outcome of the activity is the implementation of a national network of biological research collections, including all the existing in vivo and ex-situ collections of biological organisms (animals, plants, fungi, algae, archaea, bacteria, viruses, etc.) that have been created and maintained through past and current research projects. BioMemory (CNR-DiSBA Project No. SAC.AD002.173) is the network of biological collections of the Department of Biology, Agriculture and Food Sciences (DiSBA) of the National Research Council of Italy (CNR) for bio-monitoring, biodiversity conservation, agri-food and environmental sustainability, and human well-being. The project aims to create a network of biobanks (i.e., scientific research collections) where data and metadata associated with biological samples of different natures are collected and stored in a systematic and well-organized way. Maintaining the existing collections will allow their future use for many purposes, from the genetic improvement of organisms to face environmental changes (climate-ready organisms) to the fight against epidemics and pandemics affecting humans, animals, and plants.

Título ITINERIS - Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System | BIOMEMORY Project
Identificador PNRR Project IR0000032 | CNR-DiSBA no. SAC.AD002.173
Fuentes de Financiación PNRR project IR0000032 - ITINERIS, Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System - CUP B53C22002150006 (D.D. n. 130/2022) Funded by the EU - Next Generation EU - Mission 4 “Education and Research” - Component 2: “From research to business” - Investment 3.1: “Fund for the realisation of an integrated system of research and innovation infrastructures” || BioMemory (CNR-DiSBA Project No. SAC.AD002.173)
Project Award BioMemory Project (CNR-DiSBA)
https://doi.org/10.13039/501100004462
Consiglio Nazionale delle Ricerche
CNR-DiSBA no. SAC.AD002.173
https://www.disba.cnr.it/en/

ITINERIS - Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System
https://doi.org/10.13039/501100021856
Ministero dell'Università e della Ricerca
PNRR Project IR0000032
https://itineris.cnr.it/

Personas asociadas al proyecto:

Gabriele Bucci
  • Custodio De Los Datos
Giovanni Giuseppe Vendramin
  • Investigador Principal
Eleonora Fornaro
  • Programador
Marina Tumolo
  • Autor
Domenico De Paola
  • Autor
Massimo Ianigro
  • Programador

Datos de la colección

Nombre de la Colección DNA and samples for genetic analyses on forest trees (CNR-IBBR-DNAFOR)
Identificador de la Colección 90a41989-9906-41d4-aff9-0dc8420c7a45
Métodos de preservación de los ejemplares Congelado,  Secado

Referencias bibliográficas

  1. Piotti, A., Leonarduzzi, C., Postolache, D., Bagnoli, F., Spanu, I., Brousseau, L., Urbinati, C., Leonardi, S. and Vendramin, G.G. (2017), Unexpected scenarios from Mediterranean refugial areas: disentangling complex demographic dynamics along the Apennine distribution of silver fir. Journal of Biogeography, 44: 1547-1558. https://doi.org/10.1111/jbi.13011
  2. Santini F., Andrisano T., Leonardi S., Ciaschetti G., Labriola M.C., Vendramin G.G., Piotti A. (2018). Tracking the origin of silver fir plantations along the boundary between different genetic clusters in central Apennines: Implications for their management. Forest Ecology and Management 408: 220-227. https://doi.org/10.1016/j.foreco.2017.10.045

Metadatos adicionales

A sample of preserved material is available upon request for authors.

Agradecimientos

PNRR Project IR0000032—ITINERIS, Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System—CUP B53C22002150006 (D.D. n. 130/2022) Funded by the EU—Next Generation EU—Mission 4 “Education and Research”—Component 2: “From research to business”—Investment 3.1: “Fund for the realization of an integrated system of research and innovation infrastructures”

CNR-DiSBA Project No. SAC.AD002.173 BioMemory - Network of scientific collections for bio-monitoring, biodiversity conservation, agri-food and environmental sustainability, and well-being.
Propósito

Population genetics, Infraspecific biodiversity, Phylogeography, Adaptation, Climate change
Descripción de mantenimiento Dried tissues and DNA at -20 °C
Identificadores alternativos b039a7fc-9e9a-438e-9187-5ada8a69c5b3
https://ipt.ibbr.cnr.it/ipt/resource?r=ibbr-abies-alba