Abies alba natural populations of Italy and Balkans (IBBR-ABIES-ALBA)

Occurrence
Dernière version Publié par Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR) le févr. 18, 2025 Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR)

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Description

Some 1168 silver fir trees from 24 natural populations sampled across italy and the Balkanian peninsula have been fully genotyped using a set of 16 SSR loci. Needles have been collected from georeferenced, individual trees in the forest, transported to the lab and kept at -80 °C for long-term storage. DNA has been extracted from each tissue sample for purpose of population genetic studies and evolutionary history reconstruction, and it is currently maintained at -20 *C for future research.

Enregistrements de données

Les données de cette ressource occurrence ont été publiées sous forme d'une Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant qu'ensemble d'un ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 1 167 enregistrements.

1 tableurs de données d'extension existent également. Un enregistrement d'extension fournit des informations supplémentaires sur un enregistrement du cœur de standard (core). Le nombre d'enregistrements dans chaque tableur de données d'extension est illustré ci-dessous.

Occurrence (noyau)
1167
Amplification 
18672

Cet IPT archive les données et sert donc de dépôt de données. Les données et métadonnées de la ressource sont disponibles pour téléchargement dans la section téléchargements. Le tableau des versions liste les autres versions de chaque ressource rendues disponibles de façon publique et permet de tracer les modifications apportées à la ressource au fil du temps.

Versions

Le tableau ci-dessous n'affiche que les versions publiées de la ressource accessibles publiquement.

Comment citer

Les chercheurs doivent citer cette ressource comme suit:

Piotti A, Bagnoli F, Avanzi C, Spanu I, Vendramin G G, Postolache D, Brousseau L, Leonarduzzi C, Leonardi S, Bucci G, Ianigro M (2025). Abies alba natural populations of Italy and Balkans (IBBR-ABIES-ALBA). Version 1.2. Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR). Occurrence dataset. https://doi.org/10.15468/3ccqf4

Droits

Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:

L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR). Ce travail est sous licence Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0.

Enregistrement GBIF

Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède l'UUID GBIF suivante : b039a7fc-9e9a-438e-9187-5ada8a69c5b3.  Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR) publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec l'approbation du DiSSCo.

Mots-clé

Occurrence; Silver fir; Conservation; Forest trees; Abies alba; Genetic diversity; Gene flow; Specimen

Données externes

Les données de la ressource sont disponibles dans d'autres formats

Contacts

Andrea Piotti
  • Personne De Contact
  • Researcher
CNR-IBBR-FI, Institute of Biosciences and Bioresources (IBBR) - Section of Sesto Fiorentino, National Research Council of Italy
  • v. Madonna del Piano 10
I-50019 Sesto Fiorentino
FI
IT
Francesca Bagnoli
  • Créateur
  • Researcher
CNR-IBBR-FI, Institute of Biosciences and Bioresources (IBBR) - Section of Sesto Fiorentino, National Research Council of Italy
  • v. Madonna del Piano 10
I-50019 Sesto Fiorentino
FI
IT
Camilla Avanzi
  • Créateur
  • Researcher
CNR-IBBR-FI, Institute of Biosciences and Bioresources (IBBR) - Section of Sesto Fiorentino, National Research Council of Italy
  • v. Madonna del Piano 10
I-50019 Sesto Fiorentino
FI
IT
Ilaria Spanu
  • Créateur
  • Researcher
CNR-IBBR-FI, Institute of Biosciences and Bioresources (IBBR) - Section of Sesto Fiorentino, National Research Council of Italy
  • v. Madonna del Piano 10
I-50019 Sesto Fiorentino
FI
IT
Giovanni Giuseppe Vendramin
  • Créateur
  • Research Director
CNR-IBBR-FI, Institute of Biosciences and Bioresources (IBBR) - Section of Sesto Fiorentino, National Research Council of Italy
  • v. Madonna del Piano 10
I-50019 Sesto Fiorentino
FI
IT
Dragos Postolache
  • Créateur
National Research and Development Institute in Forestry "Marin Dracea"
400275 Cluj-Napoca
RO
Louise Brousseau
  • Créateur
INRA, UR629 URFM Ecologie des Forêts Méditerranéennes
  • Domaine Saint Paul
84914 Avignon Cedex 9
FR
Cristina Leonarduzzi
  • Créateur
CNR-IBBR Institute of Biosciences and Bioresources, National Research Council of Italy
IT-50019 Sesto Fiorentino
FI
IT
Stefano Leonardi
  • Créateur
University of Parma
43124 Parma
IT
Gabriele Bucci
  • Fournisseur Des Métadonnées
  • Senior Researcher
CNR-IBBR, Institute of Biosciences and BioResources, National Research Council of Italy
  • v. Madonna del Piano 10
I-50019 Sesto Fiorentino
FI
Massimo Ianigro
  • Fournisseur Des Métadonnées
  • Senior Technologist
CNR-IRSA-BA, Water Research Institute (IRSA) - Section of Bari, National Research Council of Italy
  • v. F. De Blasio 5
I-70132 Bari
BA
IT
Andrea Piotti
  • Personne De Contact
  • Reference Person
CNR-IBBR-FI, Institute of Biosciences and Bioresources (IBBR) - Section of Sesto Fiorentino
  • v. Madonna del Piano 10
I-50019 Sesto Fiorentino
FI
IT
Institute of Biosciences and BioResources CNR-IBBR
  • Fournisseur De Contenu
  • Research Institute
National Research Council of Italy (CNR)
  • v. Madonna del Piano 10
I-50019 Sesto Fiorentino
FI
IT
Dept. of Bio-Agrifood Sciences
  • Propriétaire
National Research Council of Italy (CNR)
IT-00100 Rome
RM
IT

Couverture géographique

Italy, Romania, Bulgaria, Serbia

Enveloppe géographique Sud Ouest [38,144, 6,889], Nord Est [46,49, 24,696]

Couverture taxonomique

Natural populations of Abies alba Mill.

Kingdom Plantae
Phylum Tracheophyta
Class Pinopsida
Order Pinales
Family Pinaceae

Couverture temporelle

Epoque de formation 2016-2017

Données sur le projet

ITINERIS - Activity 6.5 "Mining and mapping the functional biodiversity in vivo and ex-situ research collections" - This activity aims to provide biodiversity (meta)data linked to Natural Science Collections (NSC) in terms of extended digital specimens fully linked to related information (e.g.. images and videos, codification of functional traits, DNA and protein sequences, environmental parameters, etc.). The expected outcome of the activity is the implementation of a national network of biological research collections, including all the existing in vivo and ex-situ collections of biological organisms (animals, plants, fungi, algae, archaea, bacteria, viruses, etc.) that have been created and maintained through past and current research projects. BioMemory (CNR-DiSBA Project No. SAC.AD002.173) is the network of biological collections of the Department of Biology, Agriculture and Food Sciences (DiSBA) of the National Research Council of Italy (CNR) for bio-monitoring, biodiversity conservation, agri-food and environmental sustainability, and human well-being. The project aims to create a network of biobanks (i.e., scientific research collections) where data and metadata associated with biological samples of different natures are collected and stored in a systematic and well-organized way. Maintaining the existing collections will allow their future use for many purposes, from the genetic improvement of organisms to face environmental changes (climate-ready organisms) to the fight against epidemics and pandemics affecting humans, animals, and plants.

Titre ITINERIS - Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System | BIOMEMORY Project
Identifiant PNRR Project IR0000032 | CNR-DiSBA no. SAC.AD002.173
Financement PNRR project IR0000032 - ITINERIS, Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System - CUP B53C22002150006 (D.D. n. 130/2022) Funded by the EU - Next Generation EU - Mission 4 “Education and Research” - Component 2: “From research to business” - Investment 3.1: “Fund for the realisation of an integrated system of research and innovation infrastructures” || BioMemory (CNR-DiSBA Project No. SAC.AD002.173)
Project Award BioMemory Project (CNR-DiSBA)
https://doi.org/10.13039/501100004462
Consiglio Nazionale delle Ricerche
CNR-DiSBA no. SAC.AD002.173
https://www.disba.cnr.it/en/

ITINERIS - Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System
https://doi.org/10.13039/501100021856
Ministero dell'Università e della Ricerca
PNRR Project IR0000032
https://itineris.cnr.it/

Les personnes impliquées dans le projet:

Gabriele Bucci
Giovanni Giuseppe Vendramin
Eleonora Fornaro
Massimo Ianigro

Données de collection

Nom de la collection DNA and samples for genetic analyses on forest trees (CNR-IBBR-DNAFOR)
Identifiant de collection 90a41989-9906-41d4-aff9-0dc8420c7a45
Méthode de conservation des spécimens Deep frozen,  Dried

Citations bibliographiques

  1. Piotti, A., Leonarduzzi, C., Postolache, D., Bagnoli, F., Spanu, I., Brousseau, L., Urbinati, C., Leonardi, S. and Vendramin, G.G. (2017), Unexpected scenarios from Mediterranean refugial areas: disentangling complex demographic dynamics along the Apennine distribution of silver fir. Journal of Biogeography, 44: 1547-1558. https://doi.org/10.1111/jbi.13011
  2. Santini F., Andrisano T., Leonardi S., Ciaschetti G., Labriola M.C., Vendramin G.G., Piotti A. (2018). Tracking the origin of silver fir plantations along the boundary between different genetic clusters in central Apennines: Implications for their management. Forest Ecology and Management 408: 220-227. https://doi.org/10.1016/j.foreco.2017.10.045

Métadonnées additionnelles

A sample of preserved material is available upon request for authors.

Acknowledgements

PNRR Project IR0000032—ITINERIS, Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System—CUP B53C22002150006 (D.D. n. 130/2022) Funded by the EU—Next Generation EU—Mission 4 “Education and Research”—Component 2: “From research to business”—Investment 3.1: “Fund for the realization of an integrated system of research and innovation infrastructures”

CNR-DiSBA Project No. SAC.AD002.173 BioMemory - Network of scientific collections for bio-monitoring, biodiversity conservation, agri-food and environmental sustainability, and well-being.

Objet

Population genetics, Infraspecific biodiversity, Phylogeography, Adaptation, Climate change

Description de la fréquence de mise à jour Dried tissues and DNA at -20 °C
Identifiants alternatifs b039a7fc-9e9a-438e-9187-5ada8a69c5b3
https://ipt.ibbr.cnr.it/ipt/resource?r=ibbr-abies-alba