IPSP Dataset of Bacterial Species Collection (IPSP-BAC)

Ocorrência
Versão mais recente published by Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR) on ago 14, 2024 Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR)

Baixe a última versão do recurso de dados, como um Darwin Core Archive (DwC-A) ou recurso de metadados, como EML ou RTF:

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Descrição

The CNR-IPSP-BAC includes about 100 bacterial strains isolated from different host plants from the Mediterranean area, including pathogenic or beneficial plant bacterial species belonging to Agrobacterium, Bacillus, Erwinia and Pseudomonas genera. Preservation techniques - Cryo: bacterial suspensions in water glycerol (30% v/v) stored at- 80 °C in cryovials; Fresh cultures: bacterial suspensions in ultrapure water stored at 4 °C in plastic tubes. Aims: Taxonomical Identification (morphological, biochemical and molecular), isolation, preservation and cultivation of microorganisms.

Registros de Dados

Os dados deste recurso de ocorrência foram publicados como um Darwin Core Archive (DwC-A), que é o formato padronizado para compartilhamento de dados de biodiversidade como um conjunto de uma ou mais tabelas de dados. A tabela de dados do núcleo contém 36 registros.

Também existem 3 tabelas de dados de extensão. Um registro de extensão fornece informações adicionais sobre um registro do núcleo. O número de registros em cada tabela de dados de extensão é ilustrado abaixo.

Occurrence (core)
36
Preparation 
36
Preservation 
36
GermplasmAccession 
36

This IPT archives the data and thus serves as the data repository. The data and resource metadata are available for download in the downloads section. The versions table lists other versions of the resource that have been made publicly available and allows tracking changes made to the resource over time.

Versões

A tabela abaixo mostra apenas versões de recursos que são publicamente acessíveis.

Como citar

Pesquisadores deveriam citar esta obra da seguinte maneira:

Raio A, Schillaci M (2024). IPSP Dataset of Bacterial Species Collection (IPSP-BAC). Version 1.0. GBIF Secretariat. Occurrence dataset. https://www.gbif.org/dataset/

Direitos

Pesquisadores devem respeitar a seguinte declaração de direitos:

O editor e o detentor dos direitos deste trabalho é Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR). This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC 4.0) License.

GBIF Registration

Este recurso foi registrado no GBIF e atribuído ao seguinte GBIF UUID: 2a5f75af-401e-4362-850e-b6efb6849dd1.  Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR) publica este recurso, e está registrado no GBIF como um publicador de dados aprovado por DiSSCo.

Palavras-chave

Occurrence; Agriculture; Biocontrol agents; PGPR; Specimen

Dados externos

Os dados de recurso também estão disponíveis em outros formatos

Contatos

Aida Raio
  • Ponto De Contato
  • Curator and scientific responsible of the collection of bacterial species
CNR-IPSP-FI, Institute for Sustainable Plant Protection (IPSP) - Section of Sesto Fiorentino (Florence), National Research Council of Italy
  • Via Madonna del Piano 10
I-50019 Sesto Fiorentino
FI
IT
Martino Schillaci
  • Originador
  • Post-doc
CNR-IPSP-BA, Institute for Sustainable Plant Protection (IPSP) - Section of Bari, National Research Council of Italy
  • Via Amendola 122/D
I-70126 Bari
BA
IT
Gabriele Bucci
  • Provedor Dos Metadados
  • Senior Researcher
CNR-IBBR, Institute of Biosciences and BioResources, National Research Council of Italy
  • v. Madonna del Piano 10
I-50019 Sesto Fiorentino
FI
Aida Raio
  • Ponto De Contato
  • Reference Person
CNR-IPSP-FI, Institute for Sustainable Plant Protection (IPSP) - Section of Sesto Fiorentino (Florence)
  • Via Madonna del Piano 10
I-50019 Sesto Fiorentino
FI
IT
Dept. of Bio-Agrifood Sciences
  • Provedor De Conteúdo
  • Research Department
National Research Council of Italy (CNR)
  • p.le Aldo Moro 7
Rome
RM
IT

Cobertura Geográfica

Italy, Algeria, Pakistan, United States of America

Coordenadas delimitadoras Sul Oeste [-90, -180], Norte Leste [90, 180]

Cobertura Temporal

Período de Formação 2013-current

Dados Sobre o Projeto

ITINERIS (PNRR Project IR0000032) Activity 6.5 "Mining and mapping the functional biodiversity in vivo and ex-situ research collections" - This activity is aimed to provide biodiversity (meta)data linked to Natural Science Collections (NSC) in terms of extended digital specimens fully linked to related information (e.g.. images and videos, codification of functional traits, DNA and protein sequences, environmental parameters, etc.). The expected outcome of the activity is the implementation of a national network of biological research collections, including all the existing in vivo and ex-situ collections of biological organisms (animals, plants, fungi, algae, archaea, bacteria, viruses, etc.) which have been created and maintained through past and current research projects. The full digitization of the research collections currently offline will be achieved along with the reorganization, standardization and harmonization of the data and metadata currently available in the main online collections. All the taxonomic, genetic, geographical, ecological, physiological information for each specimen will be organized in an easily searchable platform supported by web-GIS functionalities. Reference to genetic/genomic data for each specimen will allow for the identification of the most interesting material for further genetic/genomic analysis. The availability of such huge amount of information on plant, animal, and microbial genetic resources will pave the way for the dissection of the morpho-physiological and molecular mechanisms of adaptation to climate change. BIOMEMORY (CNR-DiSBA Project No. SAC.AD002.173) is the network of biological collections of the Department of Biology, Agriculture and Food Sciences (DiSBA) of the National Research Council of Italy (CNR) for bio-monitoring, biodiversity conservation, agri-food and environmental sustainability, and human well-being. The project is aimed to create a network of biobanks (i.e., scientific research collections) where data and metadata associated to biological samples of different nature are collected and stored in a systematic and well-organized way. Maintaining the existing collections will allow their future use for a number of purposes, from the genetic improvement of organisms to face environmental changes (climate-ready organisms) to the fight against epidemics and pandemics affecting humans, animals and plants.

Título ITINERIS - Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System / BIOMEMORY
Identificador PNRR Project IR0000032 | CNR SAC.AD002.173
Financiamento ITINERIS project no. IR0000032 — ITINERIS, Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System—CUP B53C22002150006 (D.D. n. 130/2022) Funded by the EU—Next Generation EU—Mission 4 “Education and Research”—Component 2: “From research to business”—Investment 3.1: “Fund for the realisation of an integrated system of research and innovation infrastructures” || BIOMEMORY (CNR-DiSBA Project No. SAC.AD002.173).

O pessoal envolvido no projeto:

Giovanni Giuseppe Vendramin
Mauro Centritto

Dados de Coleção

Nome da Coleção IPSP Collection of Bacterial Species
Identificador da Coleção 976e0760-4db6-4209-afa4-17c4098b78f3
Métodos de preservação do espécime Congelado,  Refrigerado

Metadados Adicionais

Data and samples collected and analyzed within the following research projects: Partner of MIRRI Italian Node (www.mirri-it.it);

Propósito

Agriculture, Biocontrol agents, PGPR

Descrição da manutenção Cryo: bacterial suspensions in water glycerol (30% v/v) stored at- 80 °C in cryovials; Fresh cultures: bacterial suspensions in ultrapure water stored at 4°C in plastic tubes
Identificadores alternativos 2a5f75af-401e-4362-850e-b6efb6849dd1
https://ipt.ibbr.cnr.it/ipt/resource?r=ipsp-fi-bac