IPSP Dataset of Bacterial Species Collection (IPSP-BAC)

オカレンス(観察データと標本)
最新バージョン Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR) により出版 8月 14, 2024 Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR)

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説明

The CNR-IPSP-BAC includes about 100 bacterial strains isolated from different host plants from the Mediterranean area, including pathogenic or beneficial plant bacterial species belonging to Agrobacterium, Bacillus, Erwinia and Pseudomonas genera. Preservation techniques - Cryo: bacterial suspensions in water glycerol (30% v/v) stored at- 80 °C in cryovials; Fresh cultures: bacterial suspensions in ultrapure water stored at 4 °C in plastic tubes. Aims: Taxonomical Identification (morphological, biochemical and molecular), isolation, preservation and cultivation of microorganisms.

データ レコード

この オカレンス(観察データと標本) リソース内のデータは、1 つまたは複数のデータ テーブルとして生物多様性データを共有するための標準化された形式であるダーウィン コア アーカイブ (DwC-A) として公開されています。 コア データ テーブルには、36 レコードが含まれています。

拡張データ テーブルは3 件存在しています。拡張レコードは、コアのレコードについての追加情報を提供するものです。 各拡張データ テーブル内のレコード数を以下に示します。

Occurrence (コア)
36
Preparation 
36
Preservation 
36
GermplasmAccession 
36

この IPT はデータをアーカイブし、データ リポジトリとして機能します。データとリソースのメタデータは、 ダウンロード セクションからダウンロードできます。 バージョン テーブルから公開可能な他のバージョンを閲覧でき、リソースに加えられた変更を知ることができます。

バージョン

次の表は、公にアクセス可能な公開バージョンのリソースのみ表示しています。

引用方法

研究者はこの研究内容を以下のように引用する必要があります。:

Raio A, Schillaci M (2024). IPSP Dataset of Bacterial Species Collection (IPSP-BAC). Version 1.0. GBIF Secretariat. Occurrence dataset. https://www.gbif.org/dataset/

権利

研究者は権利に関する下記ステートメントを尊重する必要があります。:

パブリッシャーとライセンス保持者権利者は Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR)。 This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC 4.0) License.

GBIF登録

このリソースをはGBIF と登録されており GBIF UUID: 2a5f75af-401e-4362-850e-b6efb6849dd1が割り当てられています。   DiSSCo によって承認されたデータ パブリッシャーとして GBIF に登録されているConsiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR) が、このリソースをパブリッシュしました。

キーワード

Occurrence; Agriculture; Biocontrol agents; PGPR; Specimen

外部データ

リソース データは他の形式で入手可能です。

連絡先

Aida Raio
  • 連絡先
  • Curator and scientific responsible of the collection of bacterial species
CNR-IPSP-FI, Institute for Sustainable Plant Protection (IPSP) - Section of Sesto Fiorentino (Florence), National Research Council of Italy
  • Via Madonna del Piano 10
I-50019 Sesto Fiorentino
FI
IT
Martino Schillaci
  • 最初のデータ採集者
  • Post-doc
CNR-IPSP-BA, Institute for Sustainable Plant Protection (IPSP) - Section of Bari, National Research Council of Italy
  • Via Amendola 122/D
I-70126 Bari
BA
IT
Gabriele Bucci
  • メタデータ提供者
  • Senior Researcher
CNR-IBBR, Institute of Biosciences and BioResources, National Research Council of Italy
  • v. Madonna del Piano 10
I-50019 Sesto Fiorentino
FI
Aida Raio
  • 連絡先
  • Reference Person
CNR-IPSP-FI, Institute for Sustainable Plant Protection (IPSP) - Section of Sesto Fiorentino (Florence)
  • Via Madonna del Piano 10
I-50019 Sesto Fiorentino
FI
IT
Dept. of Bio-Agrifood Sciences
  • データ提供者
  • Research Department
National Research Council of Italy (CNR)
  • p.le Aldo Moro 7
Rome
RM
IT

地理的範囲

Italy, Algeria, Pakistan, United States of America

座標(緯度経度) 南 西 [-90, -180], 北 東 [90, 180]

時間的範囲

生成(収集)期間 2013-current

プロジェクトデータ

ITINERIS (PNRR Project IR0000032) Activity 6.5 "Mining and mapping the functional biodiversity in vivo and ex-situ research collections" - This activity is aimed to provide biodiversity (meta)data linked to Natural Science Collections (NSC) in terms of extended digital specimens fully linked to related information (e.g.. images and videos, codification of functional traits, DNA and protein sequences, environmental parameters, etc.). The expected outcome of the activity is the implementation of a national network of biological research collections, including all the existing in vivo and ex-situ collections of biological organisms (animals, plants, fungi, algae, archaea, bacteria, viruses, etc.) which have been created and maintained through past and current research projects. The full digitization of the research collections currently offline will be achieved along with the reorganization, standardization and harmonization of the data and metadata currently available in the main online collections. All the taxonomic, genetic, geographical, ecological, physiological information for each specimen will be organized in an easily searchable platform supported by web-GIS functionalities. Reference to genetic/genomic data for each specimen will allow for the identification of the most interesting material for further genetic/genomic analysis. The availability of such huge amount of information on plant, animal, and microbial genetic resources will pave the way for the dissection of the morpho-physiological and molecular mechanisms of adaptation to climate change. BIOMEMORY (CNR-DiSBA Project No. SAC.AD002.173) is the network of biological collections of the Department of Biology, Agriculture and Food Sciences (DiSBA) of the National Research Council of Italy (CNR) for bio-monitoring, biodiversity conservation, agri-food and environmental sustainability, and human well-being. The project is aimed to create a network of biobanks (i.e., scientific research collections) where data and metadata associated to biological samples of different nature are collected and stored in a systematic and well-organized way. Maintaining the existing collections will allow their future use for a number of purposes, from the genetic improvement of organisms to face environmental changes (climate-ready organisms) to the fight against epidemics and pandemics affecting humans, animals and plants.

タイトル ITINERIS - Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System / BIOMEMORY
識別子 PNRR Project IR0000032 | CNR SAC.AD002.173
ファンデイング ITINERIS project no. IR0000032 — ITINERIS, Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System—CUP B53C22002150006 (D.D. n. 130/2022) Funded by the EU—Next Generation EU—Mission 4 “Education and Research”—Component 2: “From research to business”—Investment 3.1: “Fund for the realisation of an integrated system of research and innovation infrastructures” || BIOMEMORY (CNR-DiSBA Project No. SAC.AD002.173).

プロジェクトに携わる要員:

Giovanni Giuseppe Vendramin
Mauro Centritto

コレクションデータ

コレクション名 IPSP Collection of Bacterial Species
コレクション識別子 976e0760-4db6-4209-afa4-17c4098b78f3
標本保存方法 Deep frozen,  Refrigerated

追加のメタデータ

Data and samples collected and analyzed within the following research projects: Partner of MIRRI Italian Node (www.mirri-it.it);

目的

Agriculture, Biocontrol agents, PGPR

メンテナンス内容 Cryo: bacterial suspensions in water glycerol (30% v/v) stored at- 80 °C in cryovials; Fresh cultures: bacterial suspensions in ultrapure water stored at 4°C in plastic tubes
代替識別子 2a5f75af-401e-4362-850e-b6efb6849dd1
https://ipt.ibbr.cnr.it/ipt/resource?r=ipsp-fi-bac