Microbiology Lab IBBA Pisa Bacterial Collection (IBBA-MLIP-BACTERIA)

Occurrence
Последняя версия опубликовано Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR) февр. 18, 2025 Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR)
Домой:
https://biomemory.cnr.it/collections/CNR-IBBA-MLIP
Дата публикации:
18 февраля 2025 г.
Лицензия:
CC-BY-NC 4.0

Скачайте последнюю версию данных этого ресурса в формате Darwin Core Archive (DwC-A) или метаданных ресурса в форматах EML или RTF:

Данные в формате DwC-A Скачать 204 Записи в English (43 KB) - Частота обновления: по мере необходимости
Метаданные в формате EML Скачать в English (28 KB)
Метаданные в формате RTF Скачать в English (12 KB)

Описание

MLIP collection preserves fungal, microalgal and bacterial strains, mainly isolated from the Mediterranean agro-food and natural systems. It contains in vivo and in vitro cultures of arbuscular mycorrhizal fungal (AMF) isolates, endophytic bacteria from Canapa sp., Psoralea sp., phycospheric and mycorrhizospheric/rhizospheric bacteria.

Записи данных

Данные этого occurrence ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 204 записей.

Также в наличии 4 таблиц с данными расширений. Записи расширений содержат дополнительную информацию об основной записи. Число записей в каждой таблице данных расширения показано ниже.

Occurrence (core)
204
Preparation 
204
Preservation 
204
GermplasmAccession 
204
dnaDerivedData 
63

Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. В таблице версий перечислены другие версии ресурса, которые были доступны публично, что позволяет отслеживать изменения, внесенные в ресурс с течением времени.

Версии

В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.

Как оформить ссылку

Исследователи должны дать ссылку на эту работу следующим образом:

Sbrana C, Chiellini C (2022). Microbiology Lab IBBA Pisa Bacteria Dataset (IBBA-MLIP-BACTERIA). CNR-IBBA Institute of Agricultural Biology and Biotechnology, National Research Council of Italy, Pisa, Italy. Version 1.0. GBIF Secretariat. Occurrence dataset. [online] URL: https://scientific-collections.gbif.org/collection/85bb62f8-dc53-41d0-b0b0-980acdaa461d

Права

Исследователи должны соблюдать следующие права:

Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR). Эта работа находится под лицензией Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC 4.0).

Регистрация в GBIF

Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: 7af9ca94-74e7-4cd5-9230-ff1f14cd748a.  Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR) отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке DiSSCo.

Ключевые слова

Occurrence; Endophytic Bacteria; Soil Bacteria; Phycospheric Bacteria; Specimen

Внешние данные

Ресурс также доступен в других форматах

API JSON https://biomemory.cnr.it/api/occurrences/json/?dataset=125 UTF-8 Darwin Core

Контакты

Cristiana Sbrana
  • Point Of Contact
  • Curator and scientific responsible of the collection
CNR-IBBA-PI, Institute of Agriculture Biology and Biotechnology (IBBA) - Section of Pisa, National Research Council of Italy
  • v. Moruzzi 1
IT-56124 Pisa
PI
IT
Carolina Chiellini
  • Originator
  • Curator and scientific responsible of the collection
CNR-IBBA-PI, Institute of Agriculture Biology and Biotechnology (IBBA) - Section of Pisa, National Research Council of Italy
  • v. Moruzzi 1
IT-56124 Pisa
PI
IT
Gabriele Bucci
  • Metadata Provider
  • Senior Researcher
CNR-IBBR, Institute of Biosciences and BioResources, National Research Council of Italy
  • v. Madonna del Piano 10
IT-50019 Sesto Fiorentino
FI
Massimo Ianigro
  • Metadata Provider
  • Senior Technologist
CNR-IRSA-BA, Water Research Institute (IRSA) - Section of Bari, National Research Council of Italy
  • v. F. De Blasio 5
IT-70132 Bari
BA
IT
Cristiana Sbrana
  • Point Of Contact
  • Reference Person
CNR-IBBA-PI, Institute of Agriculture Biology and Biotechnology (IBBA) - Section of Pisa
  • v. Moruzzi 1
IT-56124 Pisa
PI
IT
Dept. of Bio-Agrifood Sciences CNR-DiSBA
  • Content Provider
  • Research Department
National Research Council of Italy
  • p.le Aldo Moro 7
Rome
RM
IT
Institute of Agriculture Biology and Biotechnology CNR-IBBA
  • Content Provider
National Research Council of Italy
IT-56124 Pisa
PI
IT

Географический охват

Italy

Ограничивающие координаты Юг Запад [36,315, 6,328], Север Восток [47,279, 19,16]

Таксономический охват

Bacteria mainly belonging to Bacillaceae, Pseudomonadaceae, Actinobacteria, Xanthomonadaceae.

Kingdom Bacteria
Phylum Firmicutes, Bacteroidota, Proteobacteria, Actinobacteriota
Class Alphaproteobacteria, Actinomycetia, Bacilli, Gammaproteobacteria, Bacteroidia
Order Paenibacillales, Sphingobacteriales, Sphingomonadales, Cytophagales, Actinomycetales, Caulobacterales, Xanthomonadales, Staphylococcales, Pseudomonadales, Rhodobacterales, Mycobacteriales, Bacillales_B, Bacillales_A, Bacillales, Rhizobiales, Enterobacterales
Family Alteromonadaceae, Micrococcaceae, Sphingobacteriaceae, Xanthomonadaceae, Paenibacillaceae, Rhizobiaceae, Cellulomonadaceae, Beijerinckiaceae, Bacillaceae, Bacillaceae_H, Planococcaceae, Caulobacteraceae, Mycobacteriaceae, Staphylococcaceae, Rhodobacteraceae, Spirosomaceae, Microbacteriaceae, Pseudomonadaceae, Sphingomonadaceae

Временной охват

Период формирования 2001-present

Данные проекта

ITINERIS (PNRR Project IR0000032) Activity 6.5 "Mining and mapping the functional biodiversity in vivo and ex-situ research collections" - This activity is aimed to provide biodiversity (meta)data linked to Natural Science Collections (NSC) in terms of extended digital specimens fully linked to related information (e.g.. images and videos, codification of functional traits, DNA and protein sequences, environmental parameters, etc.). The expected outcome of the activity is the implementation of a national network of biological research collections, including all the existing in vivo and ex-situ collections of biological organisms (animals, plants, fungi, algae, archaea, bacteria, viruses, etc.) which have been created and maintained through past and current research projects. BIOMEMORY (CNR-DiSBA Project No. SAC.AD002.173) is the network of biological collections of the Department of Biology, Agriculture and Food Sciences (DiSBA) of the National Research Council of Italy (CNR) for bio-monitoring, biodiversity conservation, agri-food and environmental sustainability, and human well-being. The project is aimed to create a network of biobanks (i.e., scientific research collections) where data and metadata associated to biological samples of different nature are collected and stored in a systematic and well-organized way. Maintaining the existing collections will allow their future use for a number of purposes, from the genetic improvement of organisms to face environmental changes (climate-ready organisms) to the fight against epidemics and pandemics affecting humans, animals and plants.

Название ITINERIS - Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System / BIOMEMORY
Идентификатор PNRR Project IR0000032 | CNR SAC.AD002.173
Финансирование ITINERIS project no. IR0000032 — ITINERIS, Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System—CUP B53C22002150006 (D.D. n. 130/2022) Funded by the EU—Next Generation EU—Mission 4 “Education and Research”—Component 2: “From research to business”—Investment 3.1: “Fund for the realisation of an integrated system of research and innovation infrastructures” || BIOMEMORY Project (CNR-DiSBA Project No. SAC.AD002.173 - The network of biological collections for bio-monitoring, biodiversity conservation, agri-food and environmental sustainability, and human well-being
Project Award BioMemory Project (CNR-DiSBA)
https://doi.org/10.13039/501100004462
Consiglio Nazionale delle Ricerche
CNR-DiSBA no. SAC.AD002.173
https://www.disba.cnr.it/en/

ITINERIS - Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System
https://doi.org/10.13039/501100004462
Ministero dell'Università e della Ricerca
PNRR Project IR0000032
https://itineris.cnr.it/

Исполнители проекта:

Cristiana Sbrana
  • Principal Investigator
Carolina Chiellini
  • Principal Investigator
Gabriele Bucci
  • Custodian Steward
Eleonora Fornaro
  • Programmer
Marina Tumolo
  • Author
Massimo Ianigro
  • Programmer

Данные коллекции

Название коллекции Microbiology Lab IBBA Pisa Collection
Идентификатор коллекции 85bb62f8-dc53-41d0-b0b0-980acdaa461d
Методы сохранения образцов Deep frozen,  Refrigerated

Дополнительные метаданные

IBBA-MLIP-BACTERIA collection specimens are available for research use only upon request to the authors.

Acknowledgements

PNRR Project IR0000032—ITINERIS, Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System—CUP B53C22002150006 (D.D. n. 130/2022) Funded by the EU—Next Generation EU—Mission 4 “Education and Research”—Component 2: “From research to business”—Investment 3.1: “Fund for the realization of an integrated system of research and innovation infrastructures”

CNR-DiSBA Project No. SAC.AD002.173 BioMemory - Network of scientific collections for bio-monitoring, biodiversity conservation, agri-food and environmental sustainability, and well-being.
Цель

Crop biofertilizers and biostimulants (either single isolates or consortia), biocontrol agents, bioremediation, phycoremediation, source of molecules of nutraceutical interest (microalgae).
Описание частоты обновления ресурса Cryo: Frezeer at -80 °C and -20 °C, in cryovials with 20% glycerol. Fresh cultures: Refrigerator at 4°C in vials with Vials/plates streaks of bacterial isolates on agar media.
Альтернативные идентификаторы 7af9ca94-74e7-4cd5-9230-ff1f14cd748a
https://ipt.ibbr.cnr.it/ipt/resource?r=ibba-mlip-bacteria