Microbiology Lab IBBA Pisa Bacterial Collection (IBBA-MLIP-BACTERIA)

Registros biológicos
Última versión publicado por Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituti del Dipartimento di Scienze Bio-AgroAlimentari (CNR-DiSBA) el feb. 18, 2025 Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituti del Dipartimento di Scienze Bio-AgroAlimentari (CNR-DiSBA)
Inicio:
https://biomemory.cnr.it/collections/CNR-IBBA-MLIP
Fecha de publicación:
18 de febrero de 2025
Licencia:
CC-BY-NC 4.0

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Datos como un archivo DwC-A descargar 204 registros en Inglés (43 KB) - Frecuencia de actualización: cuando sea necesario
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Descripción

MLIP collection preserves fungal, microalgal and bacterial strains, mainly isolated from the Mediterranean agro-food and natural systems. It contains in vivo and in vitro cultures of arbuscular mycorrhizal fungal (AMF) isolates, endophytic bacteria from Canapa sp., Psoralea sp., phycospheric and mycorrhizospheric/rhizospheric bacteria.

Registros

Los datos en este recurso de registros biológicos han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 204 registros.

también existen 4 tablas de datos de extensiones. Un registro en una extensión provee información adicional sobre un registro en el core. El número de registros en cada tabla de datos de la extensión se ilustra a continuación.

Occurrence (core)
204
Preparation 
204
Preservation 
204
GermplasmAccession 
204
dnaDerivedData 
63

Este IPT archiva los datos y, por lo tanto, sirve como repositorio de datos. Los datos y los metadatos del recurso están disponibles para su descarga en la sección descargas. La tabla versiones enumera otras versiones del recurso que se han puesto a disposición del público y permite seguir los cambios realizados en el recurso a lo largo del tiempo.

Versiones

La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.

¿Cómo referenciar?

Los usuarios deben citar este trabajo de la siguiente manera:

Sbrana C, Chiellini C (2022). Microbiology Lab IBBA Pisa Bacteria Dataset (IBBA-MLIP-BACTERIA). CNR-IBBA Institute of Agricultural Biology and Biotechnology, National Research Council of Italy, Pisa, Italy. Version 1.0. GBIF Secretariat. Occurrence dataset. [online] URL: https://scientific-collections.gbif.org/collection/85bb62f8-dc53-41d0-b0b0-980acdaa461d

Derechos

Los usuarios deben respetar los siguientes derechos de uso:

El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituti del Dipartimento di Scienze Bio-AgroAlimentari (CNR-DiSBA). Esta obra está bajo una licencia Creative Commons de Atribución/Reconocimiento-NoComercial (CC-BY-NC 4.0).

Registro GBIF

Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: 7af9ca94-74e7-4cd5-9230-ff1f14cd748a.  Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituti del Dipartimento di Scienze Bio-AgroAlimentari (CNR-DiSBA) publica este recurso y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por DiSSCo.

Palabras clave

Occurrence; Endophytic Bacteria; Soil Bacteria; Phycospheric Bacteria; Specimen

Datos externos

Los datos del recurso también están disponibles en otros formatos

API JSON https://biomemory.cnr.it/api/occurrences/json/?dataset=125 UTF-8 Darwin Core

Contactos

Cristiana Sbrana
  • Punto De Contacto
  • Curator and scientific responsible of the collection
CNR-IBBA-PI, Institute of Agriculture Biology and Biotechnology (IBBA) - Section of Pisa, National Research Council of Italy
  • v. Moruzzi 1
IT-56124 Pisa
PI
IT
Carolina Chiellini
  • Originador
  • Curator and scientific responsible of the collection
CNR-IBBA-PI, Institute of Agriculture Biology and Biotechnology (IBBA) - Section of Pisa, National Research Council of Italy
  • v. Moruzzi 1
IT-56124 Pisa
PI
IT
Gabriele Bucci
  • Proveedor De Los Metadatos
  • Senior Researcher
CNR-IBBR, Institute of Biosciences and BioResources, National Research Council of Italy
  • v. Madonna del Piano 10
IT-50019 Sesto Fiorentino
FI
Massimo Ianigro
  • Proveedor De Los Metadatos
  • Senior Technologist
CNR-IRSA-BA, Water Research Institute (IRSA) - Section of Bari, National Research Council of Italy
  • v. F. De Blasio 5
IT-70132 Bari
BA
IT
Cristiana Sbrana
  • Punto De Contacto
  • Reference Person
CNR-IBBA-PI, Institute of Agriculture Biology and Biotechnology (IBBA) - Section of Pisa
  • v. Moruzzi 1
IT-56124 Pisa
PI
IT
Dept. of Bio-Agrifood Sciences CNR-DiSBA
  • Proveedor De Contenido
  • Research Department
National Research Council of Italy
  • p.le Aldo Moro 7
Rome
RM
IT
Institute of Agriculture Biology and Biotechnology CNR-IBBA
  • Proveedor De Contenido
National Research Council of Italy
IT-56124 Pisa
PI
IT

Cobertura geográfica

Italy

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [36,315, 6,328], Latitud Máxima Longitud Máxima [47,279, 19,16]

Cobertura taxonómica

Bacteria mainly belonging to Bacillaceae, Pseudomonadaceae, Actinobacteria, Xanthomonadaceae.

Reino Bacteria
Filo Firmicutes, Bacteroidota, Proteobacteria, Actinobacteriota
Class Alphaproteobacteria, Actinomycetia, Bacilli, Gammaproteobacteria, Bacteroidia
Orden Paenibacillales, Sphingobacteriales, Sphingomonadales, Cytophagales, Actinomycetales, Caulobacterales, Xanthomonadales, Staphylococcales, Pseudomonadales, Rhodobacterales, Mycobacteriales, Bacillales_B, Bacillales_A, Bacillales, Rhizobiales, Enterobacterales
Familia Alteromonadaceae, Micrococcaceae, Sphingobacteriaceae, Xanthomonadaceae, Paenibacillaceae, Rhizobiaceae, Cellulomonadaceae, Beijerinckiaceae, Bacillaceae, Bacillaceae_H, Planococcaceae, Caulobacteraceae, Mycobacteriaceae, Staphylococcaceae, Rhodobacteraceae, Spirosomaceae, Microbacteriaceae, Pseudomonadaceae, Sphingomonadaceae

Cobertura temporal

Periodo de formación 2001-present

Datos del proyecto

ITINERIS (PNRR Project IR0000032) Activity 6.5 "Mining and mapping the functional biodiversity in vivo and ex-situ research collections" - This activity is aimed to provide biodiversity (meta)data linked to Natural Science Collections (NSC) in terms of extended digital specimens fully linked to related information (e.g.. images and videos, codification of functional traits, DNA and protein sequences, environmental parameters, etc.). The expected outcome of the activity is the implementation of a national network of biological research collections, including all the existing in vivo and ex-situ collections of biological organisms (animals, plants, fungi, algae, archaea, bacteria, viruses, etc.) which have been created and maintained through past and current research projects. BIOMEMORY (CNR-DiSBA Project No. SAC.AD002.173) is the network of biological collections of the Department of Biology, Agriculture and Food Sciences (DiSBA) of the National Research Council of Italy (CNR) for bio-monitoring, biodiversity conservation, agri-food and environmental sustainability, and human well-being. The project is aimed to create a network of biobanks (i.e., scientific research collections) where data and metadata associated to biological samples of different nature are collected and stored in a systematic and well-organized way. Maintaining the existing collections will allow their future use for a number of purposes, from the genetic improvement of organisms to face environmental changes (climate-ready organisms) to the fight against epidemics and pandemics affecting humans, animals and plants.

Título ITINERIS - Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System / BIOMEMORY
Identificador PNRR Project IR0000032 | CNR SAC.AD002.173
Fuentes de Financiación ITINERIS project no. IR0000032 — ITINERIS, Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System—CUP B53C22002150006 (D.D. n. 130/2022) Funded by the EU—Next Generation EU—Mission 4 “Education and Research”—Component 2: “From research to business”—Investment 3.1: “Fund for the realisation of an integrated system of research and innovation infrastructures” || BIOMEMORY Project (CNR-DiSBA Project No. SAC.AD002.173 - The network of biological collections for bio-monitoring, biodiversity conservation, agri-food and environmental sustainability, and human well-being
Project Award BioMemory Project (CNR-DiSBA)
https://doi.org/10.13039/501100004462
Consiglio Nazionale delle Ricerche
CNR-DiSBA no. SAC.AD002.173
https://www.disba.cnr.it/en/

ITINERIS - Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System
https://doi.org/10.13039/501100004462
Ministero dell'Università e della Ricerca
PNRR Project IR0000032
https://itineris.cnr.it/

Personas asociadas al proyecto:

Cristiana Sbrana
  • Investigador Principal
Carolina Chiellini
  • Investigador Principal
Gabriele Bucci
  • Custodio De Los Datos
Eleonora Fornaro
  • Programador
Marina Tumolo
  • Autor
Massimo Ianigro
  • Programador

Datos de la colección

Nombre de la Colección Microbiology Lab IBBA Pisa Collection
Identificador de la Colección 85bb62f8-dc53-41d0-b0b0-980acdaa461d
Métodos de preservación de los ejemplares Congelado,  Refrigerado

Metadatos adicionales

IBBA-MLIP-BACTERIA collection specimens are available for research use only upon request to the authors.

Agradecimientos

PNRR Project IR0000032—ITINERIS, Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System—CUP B53C22002150006 (D.D. n. 130/2022) Funded by the EU—Next Generation EU—Mission 4 “Education and Research”—Component 2: “From research to business”—Investment 3.1: “Fund for the realization of an integrated system of research and innovation infrastructures”

CNR-DiSBA Project No. SAC.AD002.173 BioMemory - Network of scientific collections for bio-monitoring, biodiversity conservation, agri-food and environmental sustainability, and well-being.
Propósito

Crop biofertilizers and biostimulants (either single isolates or consortia), biocontrol agents, bioremediation, phycoremediation, source of molecules of nutraceutical interest (microalgae).
Descripción de mantenimiento Cryo: Frezeer at -80 °C and -20 °C, in cryovials with 20% glycerol. Fresh cultures: Refrigerator at 4°C in vials with Vials/plates streaks of bacterial isolates on agar media.
Identificadores alternativos 7af9ca94-74e7-4cd5-9230-ff1f14cd748a
https://ipt.ibbr.cnr.it/ipt/resource?r=ibba-mlip-bacteria