The ITEM fungal repository dataset (ISPA-ITEM-02)

Occurrence
Dernière version Publié par Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR) le août 23, 2024 Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR)

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Description

The ITEM Collection includes more than 13,000 strains belonging to various agro-food microorganisms with phytopathological and toxicological significance. Thousands strains belonging to toxigenic genera Aspergillus, Alternaria, Fusarium, and Penicillium, representing wide biodiversity to investigate strategies for reducing mycotoxin contamination. Also yeasts (300) and lactic bacteria (400) has been also preserved and characterized for autochthonous industrial fermentation of typical Apulian food.

Enregistrements de données

Les données de cette ressource occurrence ont été publiées sous forme d'une Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant qu'ensemble d'un ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 7 671 enregistrements.

2 tableurs de données d'extension existent également. Un enregistrement d'extension fournit des informations supplémentaires sur un enregistrement du cœur de standard (core). Le nombre d'enregistrements dans chaque tableur de données d'extension est illustré ci-dessous.

Occurrence (noyau)
7671
Preservation 
7671
GermplasmAccession 
7671

Cet IPT archive les données et sert donc de dépôt de données. Les données et métadonnées de la ressource sont disponibles pour téléchargement dans la section téléchargements. Le tableau des versions liste les autres versions de chaque ressource rendues disponibles de façon publique et permet de tracer les modifications apportées à la ressource au fil du temps.

Versions

Le tableau ci-dessous n'affiche que les versions publiées de la ressource accessibles publiquement.

Droits

Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:

L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR). Ce travail est sous licence Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0.

Enregistrement GBIF

Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède l'UUID GBIF suivante : e5347845-c5bd-4cff-9a5d-83ba9a7b1978.  Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto di Bioscienze e BioRisorse (CNR-IBBR) publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec l'approbation du DiSSCo.

Mots-clé

Occurrence; Fungi; Yeasts; Lactic Bacteria; Food Science; Phytopathology; Toxicology; Specimen

Données externes

Les données de la ressource sont disponibles dans d'autres formats

Contacts

Giancarlo Perrone
  • Créateur
  • Curator and scientific responsible of the collection
CNR-ISPA-BA, Institute of Sciences for Food Production (ISPA) - Section of Bari, National Research Council of Italy
  • v. Amendola 122/O
70126 Bari
BA
IT
Antonia Susca
  • Créateur
  • Responsible for Molecular characterization and Collection Database
CNR-ISPA-BA, Institute of Sciences for Food Production (ISPA) - Section of Bari, National Research Council of Italy
  • v. Amendola 122/O
70126 Bari
BA
IT
Antonio Moretti
  • Personne De Contact
  • Responsible for Morphological, physiological and biochemical characterization
CNR-ISPA-BA, Institute of Sciences for Food Production (ISPA) - Section of Bari, National Research Council of Italy
  • v. Amendola 122/O
70126 Bari
BA
IT
Antonio Francesco Logrieco
  • Créateur
  • Director of the collection
CNR-ISPA-BA, Institute of Sciences for Food Production (ISPA) - Section of Bari, National Research Council of Italy
  • v. Amendola 122/O
70126 Bari
BA
IT
Gabriele Bucci
  • Fournisseur Des Métadonnées
  • Senior Researcher
CNR-IBBR, Institute of Biosciences and BioResources, National Research Council of Italy
  • v. Madonna del Piano 10
I-50019 Sesto Fiorentino
FI
Massimo Ianigro
  • Fournisseur Des Métadonnées
  • Senior Technologist
CNR-IRSA-BA, Water Research Institute (IRSA) - Section of Bari, National Research Council of Italy
  • v. F. De Blasio 5
I-70132 Bari
BA
IT
Antonio Moretti
  • Personne De Contact
  • Reference Person
CNR-ISPA-BA, Institute of Sciences for Food Production (ISPA) - Section of Bari
  • v. Amendola 122/O
70126 Bari
BA
IT
Dept. of Bio-Agrifood Sciences
  • Fournisseur De Contenu
  • Research Department
National Research Council of Italy (CNR)
  • p.le Aldo Moro 7
Rome
RM
IT
CNR-ISPA Institute of Sciences of Food Productio
  • Propriétaire
  • Research Institute
National Research Council of Italy (CNR)
  • V. G. Amendola, 122/o
Bari
Puglia
IT

Couverture géographique

Worldwide

Enveloppe géographique Sud Ouest [-90, -180], Nord Est [90, 180]

Couverture temporelle

Epoque de formation 1952-2003

Données sur le projet

ITINERIS (PNRR Project IR0000032) Activity 6.5 "Mining and mapping the functional biodiversity in vivo and ex-situ research collections" - This activity is aimed to provide biodiversity (meta)data linked to Natural Science Collections (NSC) in terms of extended digital specimens fully linked to related information (e.g.. images and videos, codification of functional traits, DNA and protein sequences, environmental parameters, etc.). The expected outcome of the activity is the implementation of a national network of biological research collections, including all the existing in vivo and ex-situ collections of biological organisms (animals, plants, fungi, algae, archaea, bacteria, viruses, etc.) which have been created and maintained through past and current research projects. The full digitization of the research collections currently offline will be achieved along with the reorganization, standardization and harmonization of the data and metadata currently available in the main online collections. All the taxonomic, genetic, geographical, ecological, physiological information for each specimen will be organized in an easily searchable platform supported by web-GIS functionalities. Reference to genetic/genomic data for each specimen will allow for the identification of the most interesting material for further genetic/genomic analysis. The availability of such huge amount of information on plant, animal, and microbial genetic resources will pave the way for the dissection of the morpho-physiological and molecular mechanisms of adaptation to climate change. BioMemory (CNR-DiSBA Project No. SAC.AD002.173) is the network of biological collections of the Department of Biology, Agriculture and Food Sciences (DiSBA) of the National Research Council of Italy (CNR) for bio-monitoring, biodiversity conservation, agri-food and environmental sustainability, and human well-being. The project is aimed to create a network of biobanks (i.e., scientific research collections) where data and metadata associated to biological samples of different nature are collected and stored in a systematic and well-organized way. Maintaining the existing collections will allow their future use for a number of purposes, from the genetic improvement of organisms to face environmental changes (climate-ready organisms) to the fight against epidemics and pandemics affecting humans, animals and plants.

Titre ITINERIS - Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System / BIOMEMORY
Identifiant PNRR Project IR0000032 | CNR SAC.AD002.173
Financement ITINERIS project no. IR0000032 — ITINERIS, Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System—CUP B53C22002150006 (D.D. n. 130/2022) Funded by the EU—Next Generation EU—Mission 4 “Education and Research”—Component 2: “From research to business”—Investment 3.1: “Fund for the realisation of an integrated system of research and innovation infrastructures” || BioMemory (CNR-DiSBA Project No. SAC.AD002.173)

Données de collection

Nom de la collection Collezione di culture microbiche agroalimentari - Agri-Food Microbial Culture Collection (ITEM)
Identifiant de collection 21c9b326-b756-4391-b302-f3e095b947cb
Méthode de conservation des spécimens Deep frozen,  Refrigerated

Métadonnées additionnelles

Data and samples collected and analyzed within the following research projects: Partner of MIRRI Italian Node (http://www.mirri-it.it); Third parties of Horizon project IS-MIRRI21 (https://ismirri21.mirri.org/); involved in the project SUS-MIRRI (https://www.sus-mirri.it/) and CNR BioGenRes (http://www.biogenres.cnr.it/).

Objet

Agriculture, Biocontrol agents, Food, Bioremediation, Pharma, Health

Description de la fréquence de mise à jour Cryo: Ultrafrezeer at- 150 °C, in cryovials with spore suspension in water glycerol (10% v/V) or with mycelium grown on Agricultural-grade perlite; Fresh cultures: Refrigerator at 4°C in plastic tubes with spore suspension or mycelium agar plug in sterile water.
Identifiants alternatifs https://ipt.ibbr.cnr.it/ipt/resource?r=ispa-item-02